| CoV2ID_alig01 | CoV2ID_alig02 | ||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Database reference | Target | Original name | Sequence (5-3) | Position in reference genome | Genomic region | Sequence in reference genome | POS | PIS | 3'PIS | PPI | POS | PIS | 3'PIS | PPI | Detection protocols |
| CoV2ID103 | PCR primer forward | Caly_BetaCoV_RdRp_F | AAATTCTATGGTGGTTGGCACAACATGTT | 15217 - 15245 | ORF1ab | AAATTCTATGGTGGTTGGCACAACATGTT | 15267-15295 | 0.00 | 0.00 | 98.11 | 16070-16098 | 93.10 | 100.00 | 100.00 | 16 |