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Database reference Type of target Techniques Target Original name Sequence (5-3) Position in reference genome Genomic region Sequence in reference genome Detection protocols
Database reference Type of target Techniques Target Original name Sequence (5-3) Position in reference genome Genomic region Sequence in reference genome Detection protocols
CoV2ID001 PCR primer RT-PCR PCR primer forward China_CDC_Meta1_F CCCTGTGGGTTTTACACTTAA 13342-13362 ORF1ab CCCTGTGGGTTTTACACTTAA 1
CoV2ID002 PCR primer RT-PCR PCR primer reverse China_CDC_Meta1_R ACGATTGTGCATCAGCTGA 13442-13460 ORF1ab TCAGCTGATGCACAATCGT 1
CoV2ID003 Probe RT-PCR Probe China_CDC_Meta1_P CCGTCTGCGGTATGTGGAAAGGTTATGG 13377-13404 ORF1ab CCGTCTGCGGTATGTGGAAAGGTTATGG 1
CoV2ID004 PCR primer RT-PCR PCR primer forward China_CDC_Meta2_F GGGGAACTTCTCCTGCTAGAAT 28881-28902 N GGGGAACTTCTCCTGCTAGAAT 1
CoV2ID005 PCR primer RT-PCR PCR primer reverse China_CDC_Meta2_R CAGACATTTTGCTCTCAAGCTG 28958-28979 N CAGCTTGAGAGCAAAATGTCTG 1
CoV2ID006 Probe RT-PCR Probe China_CDC_Meta2_P TTGCTGCTGCTTGACAGATT 28934-28953 N TTGCTGCTGCTTGACAGATT 1
CoV2ID007 PCR primer RT-PCR PCR primer forward Charite_RdRP_SARSr-F2 GTGARATGGTCATGTGTGGCGG 15431-15452 ORF1ab GTGAAATGGTCATGTGTGGCGG 2
CoV2ID008 PCR primer RT-PCR PCR primer reverse Charite_RdRP_SARSr-R1 CARATGTTAAASACACTATTAGCATA 15505-15530 ORF1ab TATGCTAATAGTGTTTTTAACATTTG 2
CoV2ID009 Probe RT-PCR Probe Charite_RdRP_SARSr-P2 CAGGTGGAACCTCATCAGGAGATGC 15470-15494 ORF1ab CAGGTGGAACCTCATCAGGAGATGC 2
CoV2ID010 Probe RT-PCR Probe Charite_RdRP_SARSr-P1 CCAGGTGGWACRTCATCMGGTGATGC 15469-15494 ORF1ab CCAGGTGGAACCTCATCAGGAGATGC 2
CoV2ID011 PCR primer RT-PCR PCR primer forward Charite_E_Sarbeco_F1 ACAGGTACGTTAATAGTTAATAGCGT 26269-26294 E ACAGGTACGTTAATAGTTAATAGCGT 2
CoV2ID012 PCR primer RT-PCR PCR primer reverse Charite_E_Sarbeco_R2 ATATTGCAGCAGTACGCACACA 26360-26381 E TGTGTGCGTACTGCTGCAATAT 2
CoV2ID013 Probe RT-PCR Probe Charite_E_Sarbeco_P1 ACACTAGCCATCCTTACTGCGCTTCG 26332-26357 E ACACTAGCCATCCTTACTGCGCTTCG 2
CoV2ID014 PCR primer RT-PCR PCR primer forward HKU-ORF1b-nsp14F TGGGGYTTTACRGGTAACCT 18778-18797 ORF1ab TGGGGTTTTACAGGTAACCT 3
CoV2ID015 PCR primer RT-PCR PCR primer reverse HKU- ORF1b-nsp14R AACRCGCTTAACAAAGCACTC 18889-18909 ORF1b-nsp15 GAGTGCTTTGTTAAGCGTGTT 3
CoV2ID016 Probe RT-PCR Probe HKU-ORF1b-nsp141P TAGTTGTGATGCWATCATGACTAG 18849-18872 ORF1b-nsp16 TAGTTGTGATGCAATCATGACTAG 3
CoV2ID017 PCR primer RT-PCR PCR primer forward HKU-NF TAATCAGACAAGGAACTGATTA 29145-29166 N TAATCAGACAAGGAACTGATTA 3
CoV2ID018 PCR primer RT-PCR PCR primer reverse HKU-NR CGAAGGTGTGACTTCCATG 29236-29254 N CATGGAAGTCACACCTTCG 3
CoV2ID019 Probe RT-PCR Probe HKU-NP GCAAATTGTGCAATTTGCGG 29177-29196 N CCGCAAATTGCACAATTTGC 3
CoV2ID020 PCR primer RT-PCR PCR primer forward WH-NIC N-F CGTTTGGTGGACCCTCAGAT 28320-28339 N CGTTTGGTGGACCCTCAGAT 4
CoV2ID021 PCR primer RT-PCR PCR primer reverse WH-NIC N-R CCCCACTGCGTTCTCCATT 28358-28376 N AATGGAGAACGCAGTGGGG 4
CoV2ID022 Probe RT-PCR Probe WH-NIC N-P CAACTGGCAGTAACCA 28341-28356 N CAACTGGCAGTAACCA 4
CoV2ID023 PCR primer Nested PCR PCR primer forward NIID_WH-1_F501 TTCGGATGCTCGAACTGCACC 484-504 ORF1ab TTCGGATGCTCGAACTGCACC 5
CoV2ID024 PCR primer Nested PCR PCR primer reverse NIID_WH-1_R913 CTTTACCAGCACGTGCTAGAAGG 874-896 ORF1ab CCTTCTAGCACGTGCTGGTAAAG 5
CoV2ID025 PCR primer Nested PCR PCR primer forward NIID_WH-1_F509 CTCGAACTGCACCTCATGG 492-510 ORF1ab CTCGAACTGCACCTCATGG 5
CoV2ID026 PCR primer Nested PCR PCR primer reverse NIID_WH-1_R854 CAGAAGTTGTTATCGACATAGC 816-837 ORF1ab GCTATGTCGATAACAACTTCTG 5
CoV2ID027 PCR primer Nested PCR PCR primer forward NIID_WH-1_Seq_F519 ACCTCATGGTCATGTTATGG 502-521 ORF1ab ACCTCATGGTCATGTTATGG 5
CoV2ID028 PCR primer Nested PCR PCR primer reverse NIID_WH-1_Seq_R840 GACATAGCGAGTGTATGCC 805-823 ORF1ab GGCATACACTCGCTATGTC 5
CoV2ID029 PCR primer Nested PCR PCR primer forward WuhanCoV-spk1-f TTGGCAAAATTCAAGACTCACTTT 24354-24377 S TTGGCAAAATTCAAGACTCACTTT 5
CoV2ID030 PCR primer Nested PCR PCR primer reverse WuhanCoV-spk2-r TGTGGTTCATAAAAATTCCTTTGTG 24876-24900 S CACAAAGGAATTTTTATGAACCACA 5
CoV2ID031 PCR primer Nested PCR PCR primer forward NIID_WH-1_F24381 TCAAGACTCACTTTCTTCCAC 24364-24384 S TCAAGACTCACTTTCTTCCAC 5
CoV2ID032 PCR primer Nested PCR PCR primer reverse NIID_WH-1_R24873 ATTTGAAACAAAGACACCTTCAC 24834-24856 S GTGAAGGTGTCTTTGTTTCAAAT 5
CoV2ID033 PCR primer Nested PCR PCR primer forward NIID_WH-1_Seq_F24383 AAGACTCACTTTCTTCCACAG 24366-24386 S AAGACTCACTTTCTTCCACAG 5
CoV2ID034 PCR primer Nested PCR PCR primer reverse NIID_WH-1_Seq_R24865 CAAAGACACCTTCACGAGG 24830-24848 S CCTCGTGAAGGTGTCTTTG 5
CoV2ID035 PCR primer RT-PCR PCR primer forward NIID_2019-nCOV_N_F2 AAATTTTGGGGACCAGGAAC 29125-29144 N AAATTTTGGGGACCAGGAAC 5
CoV2ID036 PCR primer RT-PCR PCR primer reverse NIID_2019-nCOV_N_R2 TGGCAGCTGTGTAGGTCAAC 29263-29282 N GTTGACCTACACAGGTGCCA 5
CoV2ID037 Probe RT-PCR Probe NIID_2019-nCOV_N_P2 ATGTCGCGCATTGGCATGGA 29222-29241 N ATGTCGCGCATTGGCATGGA 5
CoV2ID038 PCR primer RT-PCR PCR primer forward CDC_2019-nCoV_N1-F GACCCCAAAATCAGCGAAAT 28287-28306 N GACCCCAAAATCAGCGAAAT 6
CoV2ID039 PCR primer RT-PCR PCR primer reverse CDC_2019-nCoV_N1-R TCTGGTTACTGCCAGTTGAATCTG 28335-28358 N CAGATTCAACTGGCAGTAACCAGA 6
CoV2ID040 Probe RT-PCR Probe CDC_2019-nCoV_N1-P ACCCCGCATTACGTTTGGTGGACC 28309-28332 N ACCCCGCATTACGTTTGGTGGACC 6
CoV2ID041 PCR primer RT-PCR PCR primer forward CDC_2019-nCoV_N2-F TTACAAACATTGGCCGCAAA 29164-29183 N TTACAAACATTGGCCGCAAA 6
CoV2ID042 PCR primer RT-PCR PCR primer reverse CDC_2019-nCoV_N2-R GCGCGACATTCCGAAGAA 29213-29230 N TTCTTCGGAATGTCGCGC 6
CoV2ID043 Probe RT-PCR Probe CDC_2019-nCoV_N2-P ACAATTTGCCCCCAGCGCTTCAG 29188-29210 N ACAATTTGCCCCCAGCGCTTCAG 6
CoV2ID044 PCR primer RT-PCR PCR primer forward CDC_2019-nCoV_N3-F GGGAGCCTTGAATACACCAAAA 28681-28702 N GGGAGCCTTGAATACACCAAAA 6
CoV2ID045 PCR primer RT-PCR PCR primer reverse CDC_2019-nCoV_N3-R TGTAGCACGATTGCAGCATTG 28732-28752 N CAATGCTGCAATCGTGCTACA 6
CoV2ID046 Probe RT-PCR Probe CDC_2019-nCoV_N3-P AYCACATTGGCACCCGCAATCCTG 28704-28727 N ATCACATTGGCACCCGCAATCCTG 6
CoV2ID047 PCR primer RT-PCR PCR primer forward Pasteur_nCoV_IP2-12669Fw ATGAGCTTAGTCCTGTTG 12690-12707 ORF1ab ATGAGCTTAGTCCTGTTG 7
CoV2ID048 PCR primer RT-PCR PCR primer reverse Pasteur_nCoV_IP2-12759Rv CTCCCTTTGTTGTGTTGT 12780-12797 ORF1ab ACAACACAACAAAGGGAG 7
CoV2ID049 Probe RT-PCR Probe Pasteur_nCoV_IP2-12696bProbe AGATGTCTTGTGCTGCCGGTA 12717-12737 ORF1ab AGATGTCTTGTGCTGCCGGTA 7
CoV2ID050 PCR primer RT-PCR PCR primer forward Pasteur_nCoV_IP4-14059Fw GGTAACTGGTATGATTTCG 14080-14098 ORF1ab GGTAACTGGTATGATTTCG 7
CoV2ID051 PCR primer RT-PCR PCR primer reverse Pasteur_nCoV_IP4-14146Rv CTGGTCAAGGTTAATATAGG 14167-14186 ORF1ab CCTATATTAACCTTGACCAG 7
CoV2ID052 Probe RT-PCR Probe Pasteur_nCoV_IP4-14084Probe TCATACAAACCACGCCAGG 14105-14123 ORF1ab TCATACAAACCACGCCAGG 7
CoV2ID053 PCR primer RT-PCR PCR primer forward RBD-qF1 CAATGGTTTAACAGGCACAGG 23191 - 23211 S CAATGGTTTAACAGGCACAGG 8
CoV2ID054 PCR primer RT-PCR PCR primer reverse RBD-qR1 CTCAAGTGTCTGTGGATCACG 23291 - 23311 S CGTGATCCACAGACACTTGAG 8
CoV2ID055 PCR primer PCR PCR primer forward ND-CoVs-951F TGTKAGRTTYCCTAAYATTAC 22540 - 22560 S TGTTAGATTTCCTAATATTAC 8
CoV2ID056 PCR primer PCR PCR primer reverse D-CoVs-1805R ACATCYTGATANARAACAGC 23387 - 23406 S GCTGTTCTTTATCAGGATGT 8
CoV2ID057 PCR primer RT-PCR PCR primer forward nCoV_2019 Forward CAAATTCTATGGTGGTTGGCACA 15216 - 15238 ORF1ab CAAATTCTATGGTGGTTGGCACA 9
CoV2ID058 PCR primer RT-PCR PCR primer reverse nCoV_2019 Reverse GGCATGGCTCTATCACATTTAGG 15298 - 15320 ORF1ab CCTAAATGTGATAGAGCCATGCC 9
CoV2ID059 Probe RT-PCR Probe CoV_Probe ATAATCCCAACCCATRAG 15280 - 15297 ORF1ab CTTATGGGTTGGGATTAT 9
CoV2ID060 Target Generation primer Target Generation N-gene-FWD IVT AATTCTAATACGACTCACTATAGGGCCAAATTGGCTACTACCGAAGAGCTAC 28519 - 28545 N CCAAATTGGCTACTACCGAAGAGCTAC 10
CoV2ID061 Target Generation primer Target Generation N-gene-REV IVT CACAGTTTGCTGTTTCTTCTGTCTCTGCGG 29420 - 29449 N CCGCAGAGACAGAAGAAACAGCAAACTGTG 10
CoV2ID062 Target Generation primer Target Generation E-gene-FWD IVT AATTCTAATACGACTCACTATAGGGCTGGTGTTGAACATGTTACCTTCTTCATC 26060 - 26088 E CTGGTGTTGAACATGTTACCTTCTTCATC 10
CoV2ID063 Target Generation primer Target Generation E-gene-REV IVT CCTATTACTAGGTTCCATTGTTC 26574 - 26596 E GAACAATGGAACCTAGTAATAGG 10
CoV2ID064 LAMP primer LAMP outer forward primer F3 2019-nCoV N-gene AACACAAGCTTTCGGCAG 29083 - 29100 N AACACAAGCTTTCGGCAG 10
CoV2ID065 LAMP primer LAMP outer backward primer B3 2019-nCoV N-gene GAAATTTGGATCTTTGTCATCC 29290 - 29311 N GGATGACAAAGATCCAAATTTC 10
CoV2ID066 LAMP primer LAMP backward inner primer BIP 2019-nCoV N-gene TGCGGCCAATGTTTGTAATCAGCCAAGGAAATTTTGGGGAC 29119 - 29137 N CCAAGGAAATTTTGGGGAC 10
CoV2ID067 LAMP primer LAMP forward inner primer FIP 2019-nCoV N-gene CGCATTGGCATGGAAGTCACTTTGATGGCACCTGTGTAG 29269 - 29287 N CTACACAGGTGCCATCAAA 10
CoV2ID068 LAMP primer LAMP loop forward primer LF 2019-nCoV N-gene TTCCTTGTCTGATTAGTTC 29141 - 29159 N GAACTAATCAGACAAGGAA 10
CoV2ID069 LAMP primer LAMP loop backward primer LB 2019-nCoV N-gene ACCTTCGGGAACGTGGTT 29248 - 29265 N ACCTTCGGGAACGTGGTT 10
CoV2ID070 LAMP primer LAMP outer forward primer F3 2019-nCoV E-gene CCGACGACGACTACTAGC 26191 - 26208 E CCGACGACGACTACTAGC 10
CoV2ID071 LAMP primer LAMP outer backward primer B3 2019-nCoV E-gene AGAGTAAACGTAAAAAGAAGGTT 26402 - 26424 E AACCTTCTTTTTACGTTTACTCT 10
CoV2ID072 LAMP primer LAMP backward inner primer BIP 2019-nCoV E-gene ACCTGTCTCTTCCGAAACGAATTTGTAAGCACAAGCTGATG 26214 - 26233 E TTTGTAAGCACAAGCTGATG 10
CoV2ID073 LAMP primer LAMP forward inner primer FIP 2019-nCoV E-gene CTAGCCATCCTTACTGCGCTACTCACGTTAACAATATTGCA 26374 - 26394 E TGCAATATTGTTAACGTGAGT 10
CoV2ID074 LAMP primer LAMP loop forward primer LF 2019-nCoV E-gene TCGATTGTGTGCGTACTGC 26355 - 26373 E TCGATTGTGTGCGTACTGC 10
CoV2ID075 LAMP primer LAMP loop backward primer LB 2019-nCoV E-gene TGAGTACATAAGTTCGTAC 26235 - 26253 E GTACGAACTTATGTACTCA 10
CoV2ID076 PCR primer RT-PCR PCR primer forward N_Sarbeco_F CACATTGGCACCCGCAATC 28706 - 28724 N CACATTGGCACCCGCAATC 11
CoV2ID077 PCR primer RT-PCR PCR primer reverse N_Sarbeco_R GAGGAACGAGAAGAGGCTTG 28814 - 28833 N CAAGCCTCTTCTCGTTCCTC 11
CoV2ID078 Probe RT-PCR Probe N_Sarbeco_P ACTTCCTCAAGGAACAACATTGCCA 28753 - 28777 N ACTTCCTCAAGGAACAACATTGCCA 11
CoV2ID079 PCR primer RT-PCR PCR primer forward nsp2f ATGCATTTGCATCAGAGGCT 1866 - 1885 ORF1ab ATGCATTTGCATCAGAGGCT 12
CoV2ID080 PCR primer RT-PCR PCR primer reverse nsp2r TTGTTATAGCGGCCTTCTGT 1951 - 1970 ORF1ab ACAGAAGGCCGCTATAACAA 12
CoV2ID081 PCR primer RT-PCR PCR primer forward N_gene_Taq1 TCTGGTAAAGGCCAACAACAA 28976 - 28996 N TCTGGTAAAGGCCAACAACAA 13
CoV2ID082 PCR primer RT-PCR PCR primer reverse N_gene_Taq2 TGTATGCTTTAGTGGCAGTACG 29057 - 29078 N CGTACTGCCACTAAAGCATACA 13
CoV2ID083 Probe RT-PCR Probe N_gene_Probe CTGTCACTAAGAAATCTGCTGCTGAGGC 29007 - 29034 N CTGTCACTAAGAAATCTGCTGCTGAGGC 13
CoV2ID084 PCR primer PCR PCR primer forward orf1ab-F CAGACCTCGTCTATGCTTTAAGGC 13814 - 13837 ORF1ab CAGACCTCGTCTATGCTTTAAGGC 14
CoV2ID085 PCR primer PCR PCR primer reverse orf1ab-R CCCTGGTCAAGGTTAATATAGGCA 14165 - 14188 ORF1ab TGCCTATATTAACCTTGACCAGGG 14
CoV2ID086 PCR primer PCR PCR primer forward S-F CTTCCCTCAGTCAGCACCTC 24715 - 24734 S CTTCCCTCAGTCAGCACCTC 14
CoV2ID087 PCR primer PCR PCR primer reverse S-R AACCAGTGTGTGCCATTTGA 24815 - 24870 S TCAAATGGCACACACTGGTT 14
CoV2ID088 LAMP primer RT-LAMP outer forward primer orf1ab-4F3 GGTATGATTTTGTAGAAAACCCA 13925 - 13947 ORF1ab GGTATGATTTTGTAGAAAACCCA 14
CoV2ID089 LAMP primer RT-LAMP outer backward primer orf1ab-4B3 CAACAGGAACTCCACTACC 14122 - 14140 ORF1ab GGTAGTGGAGTTCCTGTTG 14
CoV2ID090 LAMP primer RT-LAMP forward inner primer orf1ab-4FIP GGCATCACAGAATTGTACTGTTTTTGCGTATACGCCAACTTAGG 13958 - 13976 ORF1ab GCGTATACGCCAACTTAGG 14
CoV2ID091 LAMP primer RT-LAMP backward inner primer orf1ab-4BIP AATGCTGGTATTGTTGGTGTACTGAGGTTTGTATGAAATCACCGAA 14095 - 14115 ORF1ab TTCGGTGATTTCATACAAACC 14
CoV2ID092 LAMP primer RT-LAMP loop forward primer orf1ab-4LF AACAAAGCTTGGCGTACACGTTCA 13977 - 14000 ORF1ab TGAACGTGTACGCCAAGCTTTGTT 14
CoV2ID093 LAMP primer RT-LAMP outer forward primer S-123F3 TCTATTGCCATACCCACAA 23693 - 23711 S TCTATTGCCATACCCACAA 14
CoV2ID094 LAMP primer RT-LAMP outer backward primer S-123B3 GGTGTTTTGTAAATTTGTTTGAC 23915 - 23937 S GTCAAACAAATTTACAAAACACC 14
CoV2ID095 LAMP primer RT-LAMP forward inner primer S-123FIP CATTCAGTTGAATCACCACAAATGTGTGTTACCACAGAAATTCTACC 23724 - 23745 S GTGTTACCACAGAAATTCTACC 14
CoV2ID096 LAMP primer RT-LAMP backward inner primer S-123BIP GTTGCAATATGGCAGTTTTTGTACATTGGGTGTTTTTGTCTTGTT 23880 - 23899 S AACAAGACAAAAACACCCAA 14
CoV2ID097 LAMP primer RT-LAMP loop forward primer S-123LF ACTGATGTCTTGGTCATAGACACT 23746 - 23769 S AGTGTCTATGACCAAGACATCAGT 14
CoV2ID098 LAMP primer RT-LAMP loop backward primer S-123LB TAAACCGTGCTTTAACTGGAATAGC 23850 - 23874 S TAAACCGTGCTTTAACTGGAATAGC 14
CoV2ID099 PCR primer RT-PCR PCR primer forward Chan_S_gene_F CCTACTAAATTAAATGATCTCTGCTTTACT 22712 - 22741 S CCTACTAAATTAAATGATCTCTGCTTTACT 15
CoV2ID100 PCR primer RT-PCR PCR primer reverse Chan_S_gene_R CAAGCTATAACGCAGCCTGTA 22849 - 22869 S TACAGGCTGCGTTATAGCTTG 15
CoV2ID101 PCR primer RT-PCR PCR primer forward Chan_RdRp_gene_F CAAGTGGGGTAAGGCTAGACTTT 14965 - 14983 ORF1ab TGGGGTAAGGCTAGACTTT 15
CoV2ID102 PCR primer RT-PCR PCR primer reverse Chan_RdRp_gene_R ACTTAGGATAATCCCAACCCAT 15283 - 15302 ORF1ab ATGGGTTGGGATTATCCTAA 15
CoV2ID103 PCR primer RT-PCR PCR primer forward Caly_BetaCoV_RdRp_F AAATTCTATGGTGGTTGGCACAACATGTT 15217 - 15245 ORF1ab AAATTCTATGGTGGTTGGCACAACATGTT 16
CoV2ID104 PCR primer RT-PCR PCR primer reverse Caly_BetaCoV_RdRp_R TAGGCATAGCTCTRTCACAYTT 15301 - 15322 ORF1ab AAATGTGATAGAGCCATGCCTA 16
CoV2ID105 Probe RT-PCR Probe Caly_BetaCoV_RdRp_P TGGGTTGGGATTATC 15284 - 15298 ORF1ab TGGGTTGGGATTATC 16
CoV2ID106 PCR primer RT-PCR PCR primer forward Huang_E_gene_F ACTTCTTTTTCTTGCTTTCGTGGT 26295 - 26318 E ACTTCTTTTTCTTGCTTTCGTGGT 17
CoV2ID107 PCR primer RT-PCR PCR primer reverse Huang_E_gene_R GCAGCAGTACGCACACAATC 26357 - 26376 E GATTGTGTGCGTACTGCTGC 17
CoV2ID108 Probe RT-PCR Probe Huang_E_gene_P CTAGTTACACTAGCCATCCTTACTGC 26326 - 26351 E CTAGTTACACTAGCCATCCTTACTGC 17
CoV2ID109 PCR primer RT-PCR PCR primer forward Lu_orf1ab_F AGAAGATTGGTTAGATGATGATAGT 3193 - 3217 ORF1ab AGAAGATTGGTTAGATGATGATAGT 18
CoV2ID110 PCR primer RT-PCR PCR primer reverse Lu_orf1ab_R TTCCATCTCTAATTGAGGTTGAACC 3286 - 3310 ORF1ab GGTTCAACCTCAATTAGAGATGGAA 18
CoV2ID111 Probe RT-PCR Probe Lu_orf1ab_P TCCTCACTGCCGTCTTGTTGACCA 3229 - 3252 ORF1ab TGGTCAACAAGACGGCAGTGAGGA 18
CoV2ID112 LAMP primer RT-LAMP outer forward primer F3 2019-nCoV N1-gene TGGACCCCAAAATCAGCG 28285 - 28302 N TGGACCCCAAAATCAGCG 19
CoV2ID113 LAMP primer RT-LAMP outer backward primer B3 2019-nCoV N1-gene GCCTTGTCCTCGAGGGAAT 28468 - 28486 N ATTCCCTCGAGGACAAGGC 19
CoV2ID114 LAMP primer RT-LAMP forward inner primer FIP 2019-nCoV N1-gene CCACTGCGTTCTCCATTCTGGTAAATGCACCCCGCATTACG 28303 - 28321 N AATGCACCCCGCATTACG 19
CoV2ID115 LAMP primer RT-LAMP backward inner primer BIP 2019-nCoV N1-gene CGCGATCAAAACAACGTCGGCCCTTGCCATGTTGAGTGAGA 28438 - 28457 N TCTCACTCAACATGGCAAGG 19
CoV2ID116 LAMP primer RT-LAMP loop forward primer LF 2019-nCoV N1-gene TGAATCTGAGGGTCCACCAAA 28322 - 28342 N TTTGGTGGACCCTCAGATTCA 19
CoV2ID117 LAMP primer RT-LAMP loop backward primer LB 2019-nCoV N1-gene GGTTTACCCAATAATACTGCGTCTT 28403 - 28427 N GGTTTACCCAATAATACTGCGTCTT 19
CoV2ID118 LAMP primer RT-LAMP outer forward primer F3 2019-nCoV N15-gene AGATCACATTGGCACCCG 28702 - 28719 N AGATCACATTGGCACCCG 19
CoV2ID119 LAMP primer RT-LAMP outer backward primer B3 2019-nCoV N15-gene CCATTGCCAGCCATTCTAGC 28895 - 28914 N GCTAGAATGGCTGGCAATGG 19
CoV2ID120 LAMP primer RT-LAMP forward inner primer FIP 2019-nCoV N15-gene TGCTCCCTTCTGCGTAGAAGCCAATGCTGCAATCGTGCTAC 28732 - 28751 N CAATGCTGCAATCGTGCTAC 19
CoV2ID121 LAMP primer RT-LAMP backward inner primer BIP 2019-nCoV N15-gene GGCGGCAGTCAAGCCTCTTCCCTACTGCTGCCTGGAGTT 28864 - 28883 N AACTCCAGGCAGCAGTAGGG 19
CoV2ID122 LAMP primer RT-LAMP loop forward primer LF 2019-nCoV N15-gene GCAATGTTGTTCCTTGAGGAAGTT 28752 - 28775 N AACTTCCTCAAGGAACAACATTGC 19
CoV2ID123 LAMP primer RT-LAMP loop backward primer LB 2019-nCoV N15-gene GTTCCTCATCACGTAGTCGCAACA 28827 - 28850 N GTTCCTCATCACGTAGTCGCAACA 19
CoV2ID124 LAMP primer RT-LAMP outer forward primer F3 2019-nCoV S17-gene TCTTTCACACGTGGTGTT 21653 - 21670 S TCTTTCACACGTGGTGTT 19
CoV2ID125 LAMP primer RT-LAMP outer backward primer B3 2019-nCoV S17-gene GTACCAAAAATCCAGCCTC 21867 - 21885 S GAGGCTGGATTTTTGGTAC 19
CoV2ID126 LAMP primer RT-LAMP forward inner primer FIP 2019-nCoV S17-gene CATGGAACCAAGTAACATTGGAAAACCTGACAAAGTTTTCAGATCC 21677 - 21697 S CCTGACAAAGTTTTCAGATCC 19
CoV2ID127 LAMP primer RT-LAMP backward inner primer BIP 2019-nCoV S17-gene CTCTGGGACCAATGGTACTAAGAGGACTTCTCAGTGGAAGCA 21838 - 21855 S TGCTTCCACTGAGAAGTC 19
CoV2ID128 LAMP primer RT-LAMP loop forward primer LF 2019-nCoV S17-gene GAAAGGTAAGAACAAGTCCTGAGT 21713 - 21736 S ACTCAGGACTTGTTCTTACCTTTC 19
CoV2ID129 LAMP primer RT-LAMP loop backward primer LB 2019-nCoV S17-gene CTGTCCTACCATTTAATGATGGTGT 21807 - 21831 S CTGTCCTACCATTTAATGATGGTGT 19
CoV2ID130 LAMP primer RT-LAMP outer forward primer F3 2019-nCoV O117-gene CCCCAAAATGCTGTTGTT 1346 - 1363 ORF1ab CCCCAAAATGCTGTTGTT 19
CoV2ID131 LAMP primer RT-LAMP outer backward primer B3 2019-nCoV O117-gene TAGCACGTGGAACCCAAT 1530 - 1547 ORF1ab ATTGGGTTCCACGTGCTA 19
CoV2ID132 LAMP primer RT-LAMP forward inner primer FIP 2019-nCoV O117-gene GGTTTTCAAGCCAGATTCATTATGGATGTCACAATTCAGAAGTAGGA 1381 - 1402 ORF1ab TGTCACAATTCAGAAGTAGGA 19
CoV2ID133 LAMP primer RT-LAMP backward inner primer BIP 2019-nCoV O117-gene TCTTCGTAAGGGTGGTCGCAGCACACTTGTTATGGCAAC 1509 - 1527 ORF1ab GTTGCCATAACAAGTGTGC 19
CoV2ID134 LAMP primer RT-LAMP loop forward primer LF 2019-nCoV O117-gene TCGGCAAGACTATGCTCAGG 1403 - 1422 ORF1ab CCTGAGCATAGTCTTGCCGA 19
CoV2ID135 LAMP primer RT-LAMP loop backward primer LB 2019-nCoV O117-gene TTGCCTTTGGAGGCTGTGT 1476 - 1494 ORF1ab TTGCCTTTGGAGGCTGTGT 19
CoV2ID136 LAMP primer RT-LAMP outer forward primer F3 2019-nCoV orf1ab-gene AAACGTAATGTCATCCCTACT 15034 - 15054 ORF1ab AAACGTAATGTCATCCCTACT 20
CoV2ID137 LAMP primer RT-LAMP outer backward primer B3 2019-nCoV orf1ab-gene ACTGTTTATAGTGATGTAGAAAACC 15250 - 15274 ORF1ab ACTGTTTATAGTGATGTAGAAAACC 20
CoV2ID138 LAMP primer RT-LAMP forward inner primer FIP 2019-nCoV orf1ab-gene ACAGATAGAGACACCAGCTACGGCTCAAATGAATCTTAAGTATGCCA 15059 - 15082 ORF1ab CTCAAATGAATCTTAAGTATGCCA 20
CoV2ID139 LAMP primer RT-LAMP backward inner primer BIP 2019-nCoV orf1ab-gene ATAGCCGCCACTAAGAGGAGCCCAACCACCATAGAATTTGC 15215 - 15234 ORF1ab CAAATTCTATGGTGGTTGG 20
CoV2ID140 LAMP primer RT-LAMP loop backward primer LF 2019-nCoV orf1ab-gene TTAGTGCAAAGAATAGAGCTCGCA 15083 - 15106 N TTAGTGCAAAGAATAGAGCTCGCA 21
CoV2ID141 LAMP primer RT-LAMP outer forward primer F3 2019-nCoV N-gene GCCAAAAGGCTTCTACGCA 28774 - 28792 N GCCAAAAGGCTTCTACGCA 21
CoV2ID142 LAMP primer RT-LAMP outer backward primer B3 2019-nCoV N-gene TTGCTCTCAAGCTGGTTCAA 28952 - 28971 N TTGAACCAGCTTGAGAGCAA 21
CoV2ID143 LAMP primer RT-LAMP forward inner primer FIP 2019-nCoV N-gene TCCCCTACTGCTGCCTGGAGCAGTCAAGCCTCTTCTCGTT 28809 - 28829 N GCAGTCAAGCCTCTTCTCGTT 21
CoV2ID144 LAMP primer RT-LAMP backward inner primer BIP 2019-nCoV N-gene TCTCCTGCTAGAATGGCTGGCATCTGTCAAGCAGCAGCAAAG 28932 - 28952 N CTTTGCTGCTGCTTGACAGAT 21
CoV2ID145 LAMP primer RT-LAMP loop backward primer LB 2019-nCoV N-gene TGGCGGTGATGCTGCTCTT 28912 - 28930 N TGGCGGTGATGCTGCTCTT 21
CoV2ID146 LAMP primer RT-LAMP outer forward primer GeneN-A-F3 TGGCTACTACCGAAGAGCT 28525 - 28543 N TGGCTACTACCGAAGAGCT 22
CoV2ID147 LAMP primer RT-LAMP outer backward primer GeneN-A-B3 TGCAGCATTGTTAGCAGGAT 28722 - 28741 N ATCCTGCTAACAATGCTGCA 22
CoV2ID148 LAMP primer RT-LAMP loop forward primer GeneN-A-LF GGACTGAGATCTTTCATTTTACCGT 28566 - 28590 N ACGGTAAAATGAAAGATCTCAGTCC 22
CoV2ID149 LAMP primer RT-LAMP loop backward primer GeneN-A-LB ACTGAGGGAGCCTTGAATACA 28676 - 28696 N ACTGAGGGAGCCTTGAATACA 22
CoV2ID150 LAMP primer RT-LAMP forward inner primer GeneN-A-FIP TCTGGCCCAGTTCCTAGGTAGTCCAGACGAATTCGTGGTGG 28545 - 28563 N CCAGACGAATTCGTGGTGG 22
CoV2ID151 LAMP primer RT-LAMP backward inner primer GeneN-A-BIP AGACGGCATCATATGGGTTGCACGGGTGCCAATGTGATCT 28702 - 28719 N AGATCACATTGGCACCCG 22
CoV2ID152 LAMP primer RT-LAMP loop forward primer 2019-nCoV N-gene_LF CGACTACGTGATGAGGAACGA 28825 - 28845 N TCGTTCCTCATCACGTAGTCG 23
CoV2ID153 LAMP primer RT-LAMP loop backward primer 2019-nCoV N-gene_LB AATGGCGGTGATGCTGCTCTT 28910 - 28930 N AATGGCGGTGATGCTGCTCTT 23
CoV2ID154 LAMP primer RT-LAMP outer forward primer F3 2019-nCoV orf-gene TGCTTCAGTCAGCTGATG 13434 - 13451 ORF1ab TGCTTCAGTCAGCTGATG 23
CoV2ID155 LAMP primer RT-LAMP outer backward primer B3 2019-nCoV orf-gene TTAAATTGTCATCTTCGTCCTT 13615 - 13636 ORF1ab AAGGACGAAGATGACAATTTAA 23
CoV2ID156 LAMP primer RT-LAMP forward inner primer FIP 2019-nCoV orf-gene TCAGTACTAGTGCCTGTGCCCACAATCGTTTTTAAACGGGT 13452 - 13472 ORF1ab CACAATCGTTTTTAAACGGGT 23
CoV2ID157 LAMP primer RT-LAMP backward inner primer BIP 2019-nCoV orf-gene TCGTATACAGGGCTTTTGACATCTATCTTGGAAGCGACAACAA 13596 - 13613 ORF1ab TTGTTGTCGCTTCCAAGA 23
CoV2ID158 LAMP primer RT-LAMP loop forward primer LF 2019-nCoV orf-gene CTGCACTTACACCGCAA 13473 - 13489 ORF1ab TTGCGGTGTAAGTGCAG 23
CoV2ID159 LAMP primer RT-LAMP loop backward primer LB 2019-nCoV orf-gene GTAGCTGGTTTTGCTAAATTCC 13564 - 13585 ORF1ab GTAGCTGGTTTTGCTAAATTCC 23
CoV2ID160 LAMP primer RT-LAMP outer forward primer As1_ORF1ab_F3 GGTGGACAAATTGTCAC 2246 - 2262 ORF1ab GGTGGACAAATTGTCAC 24
CoV2ID161 LAMP primer RT-LAMP outer backward primer As1_ORF1ab_B3 CTTCTCTGGATTTAACACACTT 2420 - 2441 ORF1ab AAGTGTGTTAAATCCAGAGAAG 24
CoV2ID162 LAMP primer RT-LAMP loop forward primer As1_ORF1ab_LF TTACAAGCTTAAAGAATGTCTGAACACT 2285 - 2312 ORF1ab AGTGTTCAGACATTCTTTAAGCTTGTAA 24
CoV2ID163 LAMP primer RT-LAMP loop backward primer As1_ORF1ab_LB TTGAATTTAGGTGAAACATTTGTCACG 2372 - 2398 ORF1ab TTGAATTTAGGTGAAACATTTGTCACG 24
CoV2ID164 LAMP primer RT-LAMP forward inner primer As1_ORF1ab_FIP TCAGCACACAAAGCCAAAAATTTATCTGTGCAAAGGAAATTAAGGAG 2263 - 2284 ORF1ab CTGTGCAAAGGAAATTAAGGAG 24
CoV2ID165 LAMP primer RT-LAMP backward inner primer As1_ORF1ab_BIP TATTGGTGGAGCTAAACTTAAAGCCCTGTACAATCCCTTTGAGTG 2399 - 2418 ORF1ab CACTCAAAGGGATTGTACAG 24
CoV2ID166 LAMP primer RT-LAMP forward inner primer As1e_ORF1ab_FIP TCAGCACACAAAGCCAAAAATTTATTTTTCTGTGCAAAGGAAATTAAGGAG 2263 - 2284 ORF1ab CTGTGCAAAGGAAATTAAGGAG 24
CoV2ID167 LAMP primer RT-LAMP backward inner primer As1e_ORF1ab_BIP TATTGGTGGAGCTAAACTTAAAGCCTTTTCTGTACAATCCCTTTGAGTG 2399 - 2421 ORF1ab CACTCAAAGGGATTGTACAGAAA 24
CoV2ID168 RPA primer RT-RPA RPA forward primer Metsky_orf1ab_F gaaatTAATACGACTCACTATAgggCCAAGGTAAACCTTTGGAATTTGGTGCCAC 3130 - 3159 ORF1ab CCAAGGTAAACCTTTGGAATTTGGTGCCAC 25
CoV2ID169 RPA primer RT-RPA RPA reverse primer Metsky_orf1ab_R ACTATCATCATCTAACCAATCTTCTTCTTG 3188 - 3217 ORF1ab CAAGAAGAAGATTGGTTAGATGATGATAGT 25
CoV2ID170 RPA primer RT-RPA RPA forward primer orf1ab_F TAATACGACTCACTATAGGGACATAAACAAGCTTTGTGAAGAAATGCTGGAC 12041 - 12073 ORF1ab GACATAAACAAGCTTTGTGAAGAAATGCTGGAC 26
CoV2ID171 RPA primer RT-RPA RPA reverse primer orf1ab_R TTGAGCAGTAGCAAAAGCTGCATATGATGGAAGG 12115 - 12148 ORF1ab CCTTCCATCATATGCAGCTTTTGCTACTGCTCAA 26
CoV2ID172 gRNA CRISPR gRNA gRNA_ORF1ab GGGGAUUUAGACUACCCCAAAAACGAAGGGGACUAAAACAAACUCUGAGGCUAUAGCUUGUAAGGUU 12082 - 12109 ORF1ab AACCTTACAAGCTATAGCCTCAGAGTTT 26
CoV2ID173 LAMP primer RT-LAMP outer forward primer nCoV-N-F3 CCAGAATGGAGAACGCAGTG 28354 - 28373 N CCAGAATGGAGAACGCAGTG 27
CoV2ID174 LAMP primer RT-LAMP outer backward primer nCoV-N-B3 CCGTCACCACCACGAATT 28552 - 28569 N AATTCGTGGTGGTGACGG 27
CoV2ID175 LAMP primer RT-LAMP forward inner primer nCoV-N-FIP AGCGGTGAACCAAGACGCAGGGCGCGATCAAAACAACG 28374 - 28392 N GGGCGCGATCAAAACAACG 27
CoV2ID176 LAMP primer RT-LAMP backward inner primer nCoV-N-BIP AATTCCCTCGAGGACAAGGCGAGCTCTTCGGTAGTAGCCAA 28524 - 28543 N TTGGCTACTACCGAAGAGCT 27
CoV2ID177 LAMP primer RT-LAMP loop forward primer nCoV-N-LF TTATTGGGTAAACCTTGGGGC 28396 - 28416 N GCCCCAAGGTTTACCCAATAA 27
CoV2ID178 LAMP primer RT-LAMP loop backward primer nCoV-N-LB TTCCAATTAACACCAATAGCAGTCC 28488 - 28512 N TTCCAATTAACACCAATAGCAGTCC 27
CoV2ID179 LAMP primer RT-LAMP outer backward primer Baek_nCoV N-B3 AGCCAATTTGGTCATCTGGA 28510 - 28529 N TCCAGATGACCAAATTGGCT 28
CoV2ID180 LAMP primer RT-LAMP forward inner primer Baek_nCoV N-FIP CGTTGTTTTGATCGCGCCCCATTACGTTTGGTGGACCCTC 28315 - 28335 N CATTACGTTTGGTGGACCCTC 28
CoV2ID181 LAMP primer RT-LAMP backward inner primer Baek_nCoV N-BIP ATACTGCGTCTTGGTTCACCGCATTGGAACGCCTTGTCCTC 28476 - 28494 N GAGGACAAGGCGTTCCAAT 28
CoV2ID182 LAMP primer RT-LAMP loop forward primer Baek_nCoV N-LF TGCGTTCTCCATTCTGGTTACT 28349 - 28370 N AGTAACCAGAATGGAGAACGCA 28
CoV2ID183 LAMP primer RT-LAMP loop backward primer Baek_nCoV N-LB TCTCACTCAACATGGCAAGGAA 28438 - 28459 N TCTCACTCAACATGGCAAGGAA 28
CoV2ID184 LAMP primer RT-LAMP outer forward primer Nsp3_1-61_F3 GGAATTTGGTGCCACTTC 3145 - 3162 ORF1ab GGAATTTGGTGCCACTTC 29
CoV2ID185 LAMP primer RT-LAMP outer backward primer Nsp3_1-61_B3 CTATTCACTTCAATAGTCTGAACA 3322 - 3345 ORF1ab TGTTCAGACTATTGAAGTGAATAG 29
CoV2ID186 LAMP primer RT-LAMP forward inner primer Nsp3_1-61_FIP CTTGTTGACCAACAGTTTGTTGACTTCAACCTGAAGAAGAGCAA 3170 - 3190 ORF1ab CTTCAACCTGAAGAAGAGCAA 29
CoV2ID187 LAMP primer RT-LAMP backward inner primer Nsp3_1-61_BIP CGGCAGTGAGGACAATCAGACACTGGTGTAAGTTCCATCTC 3302 - 3321 ORF1ab GAGATGGAACTTACACCAGT 29
CoV2ID188 LAMP primer RT-LAMP loop forward primer Nsp3_1-61_LF ATCATCATCTAACCAATCTTCTTC 3191 - 3214 ORF1ab GAAGAAGATTGGTTAGATGATGAT 29
CoV2ID189 LAMP primer RT-LAMP loop backward primer Nsp3_1-61_LB TCAAACAATTGTTGAGGTTCAACC 3271 - 3294 ORF1ab TCAAACAATTGTTGAGGTTCAACC 29
CoV2ID190 LAMP primer RT-LAMP outer forward primer Nsp3_2-24_F3 TGCAACTAATAAAGCCACG 6253 - 6271 ORF1ab TGCAACTAATAAAGCCACG 29
CoV2ID191 LAMP primer RT-LAMP outer backward primer Nsp3_2-24_B3 CGTCTTTCTGTATGGTAGGATT 6425 - 6446 ORF1ab AATCCTACCATACAGAAAGACG 29
CoV2ID192 LAMP primer RT-LAMP forward inner primer Nsp3_2-24_FIP TCTGACTTCAGTACATCAAACGAATAAATACCTGGTGTATACGTTGTC 6280 - 6302 ORF1ab AAATACCTGGTGTATACGTTGTC 29
CoV2ID193 LAMP primer RT-LAMP backward inner primer Nsp3_2-24_BIP GACGCGCAGGGAATGGATAATTCCACTACTTCTTCAGAGACT 6403 - 6424 ORF1ab AGTCTCTGAAGAAGTAGTGGAA 29
CoV2ID194 LAMP primer RT-LAMP loop forward primer Nsp3_2-24_LF TGTTTCAACTGGTTTTGTGCTCCA 6305 - 6328 ORF1ab TGGAGCACAAAACCAGTTGAAACA 29
CoV2ID195 LAMP primer RT-LAMP loop backward primer Nsp3_2-24_LB TCTTGCCTGCGAAGATCTAAAAC 6379 - 6401 ORF1ab TCTTGCCTGCGAAGATCTAAAAC 29
CoV2ID196 LAMP primer RT-LAMP outer forward primer S_1-2-2_F3 CTGACAAAGTTTTCAGATCCTCAG 21678 - 21701 S CTGACAAAGTTTTCAGATCCTCAG 29
CoV2ID197 LAMP primer RT-LAMP outer backward primer S_1-2-2_B3 AGTACCAAAAATCCAGCCTCTT 21865 - 21886 S AAGAGGCTGGATTTTTGGTACT 29
CoV2ID198 LAMP primer RT-LAMP forward inner primer S_1-2-2_FIP TCCCAGAGACATGTATAGCATGGAATCAACTCAGGACTTGTTCTTACC 21710 - 21732 S TCAACTCAGGACTTGTTCTTACC 29
CoV2ID199 LAMP primer RT-LAMP backward inner primer S_1-2-2_BIP TGGTACTAAGAGGTTTGATAACCCTGTTAGACTTCTCAGTGGAAGCA 21838 - 21860 S TGCTTCCACTGAGAAGTCTAACA 29
CoV2ID200 LAMP primer RT-LAMP loop forward primer S_1-2-2_LF CCAAGTAACATTGGAAAAGAAA 21733 - 21754 S TTTCTTTTCCAATGTTACTTGG 29
CoV2ID201 LAMP primer RT-LAMP loop backward primer S_1-2-2_LB GTCCTACCATTTAATGATGGTGTTT 21809 - 21833 S GTCCTACCATTTAATGATGGTGTTT 29
CoV2ID202 LAMP primer RT-LAMP forward inner primer N_21_FIP TCCCCTACTGCTGCCTGGAGGCAGTCAAGCCTCTTCTCG 28808 - 28827 N GGCAGTCAAGCCTCTTCTCG 29
CoV2ID203 LAMP primer RT-LAMP loop forward primer N_21_LF TGTTGCGACTACGTGATGAGGA 28829 - 28850 N TCCTCATCACGTAGTCGCAACA 29
CoV2ID204 LAMP primer RT-LAMP loop backward primer N_21_LB ATGGCGGTGATGCTGCTCT 28911 - 28929 N ATGGCGGTGATGCTGCTCT 29
CoV2ID205 LAMP primer RT-LAMP outer forward primer NB-F3 ACCGAAGAGCTACCAGACG 28533 - 28551 N ACCGAAGAGCTACCAGACG 30
CoV2ID206 LAMP primer RT-LAMP forward inner primer NB-FIP TCTGGCCCAGTTCCTAGGTAGTTCGTGGTGGTGACGGTAA 28554 - 28572 N TTCGTGGTGGTGACGGTAA 30
CoV2ID207 LAMP primer RT-LAMP loop forward primer NB-LF CCATCTTGGACTGAGATCTTTCATT 28573 - 28597 N AATGAAAGATCTCAGTCCAAGATGG 30
CoV2ID208 LAMP primer RT-LAMP outer forward primer Lamb-F3 TCCAGATGAGGATGAAGAAGA 3043 - 3063 ORF1ab TCCAGATGAGGATGAAGAAGA 30
CoV2ID209 LAMP primer RT-LAMP outer backward primer Lamb-B3 AGTCTGAACAACTGGTGTAAG 3311 - 3331 ORF1ab CTTACACCAGTTGTTCAGACT 30
CoV2ID210 LAMP primer RT-LAMP forward inner primer Lamb-FIP AGAGCAGCAGAAGTGGCACAGGTGATTGTGAAGAAGAAGAG 3064 - 3085 ORF1ab AGGTGATTGTGAAGAAGAAGAG 30
CoV2ID211 LAMP primer RT-LAMP backward inner primer Lamb-BIP TCAACCTGAAGAAGAGCAAGAACTGATTGTCCTCACTGCC 3242 - 3259 ORF1ab GGCAGTGAGGACAATCAG 30
CoV2ID212 LAMP primer RT-LAMP loop forward primer Lamb-LF CTCATATTGAGTTGATGGCTCA 3088 - 3109 ORF1ab TGAGCCATCAACTCAATATGAG 30
CoV2ID213 LAMP primer RT-LAMP loop backward primer Lamb-LB ACAAACTGTTGGTCAACAAGAC 3220 - 3241 ORF1ab ACAAACTGTTGGTCAACAAGAC 30
CoV2ID214 PCR primer PCR PCR primer forward PCR-C-fwd primer ACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCTAACGCTGAAGCGCTGGGGGCAAA 29192 - 29214 N TTTGCCCCCAGCGCTTCAGCGTT 31
CoV2ID215 PCR primer PCR PCR primer reverse PCR-C-rev primer TGACTGGAGTTCAGACGTGTGCTCTTCCGATCTGTTTGTAATCAGTTCCTTGTCTG 29149 - 29172 N CAGACAAGGAACTGATTACAAACA 31
CoV2ID216 LAMP primer RT-LAMP outer backward primer Wang_N_B3 TTTGGCCTTGTTGTTGTTGG 28987 - 29006 N CCAACAACAACAAGGCCAAA 32
CoV2ID217 LAMP primer RT-LAMP forward inner primer Wang_N_FIP TCCCCTACTGCTGCCTGGAGTTTTCGGCAGTCAAGCCTCTTC 28807 - 28824 N CGGCAGTCAAGCCTCTTC 32
CoV2ID218 LAMP primer RT-LAMP backward inner primer Wang_N_BIP TCCTGCTAGAATGGCTGGCAATTTTTTTTGCTCTCAAGCTGGTTCA 28953 - 28973 N TGAACCAGCTTGAGAGCAAAA 32
CoV2ID219 LAMP primer RT-LAMP loop backward primer Wang_N_LB GCGGTGATGCTGCTCT 28914 - 28929 N GCGGTGATGCTGCTCT 32
CoV2ID220 RPA primer RT-RPA RPA forward primer E-Sarbeco_F1_RPA GAAGAGACAGGTACGTTAATAGTTAATAGCGT 26263 - 26294 E GAAGAGACAGGTACGTTAATAGTTAATAGCGT 33
CoV2ID221 RPA primer RT-RPA RPA reverse primer E-Sarbeco-R2_RPA ACGTTAACAATATTGCAGCAGTACGCACACA 26360 - 26390 E TGTGTGCGTACTGCTGCAATATTGTTAACGT 33
CoV2ID222 RPA primer RT-RPA RPA forward primer 2019-nCoV_N2-F_RPA ACAAGGAACTGATTACAAACATTGGCCGCAAA 29152 - 29183 N ACAAGGAACTGATTACAAACATTGGCCGCAAA 33
CoV2ID223 RPA primer RT-RPA RPA reverse primer 2019-nCoV_N2-R_RPA TTCCATGCCAATGCGCGACATTCCGAAGAA 29213 - 29242 N TTCTTCGGAATGTCGCGCATTGGCATGGAA 33
CoV2ID224 PCR primer RT-PCR PCR primer forward Lamb_orf1ab_F ATTTGGTGCCACTTCTGCTGC 3148 - 3168 ORF1ab ATTTGGTGCCACTTCTGCTGC 34
CoV2ID225 PCR primer RT-PCR PCR primer reverse Lamb_orf1ab_R TCACTGCCGTCTTGTTGACCA 3229 - 3249 ORF1ab TGGTCAACAAGACGGCAGTGA 34
CoV2ID226 LAMP primer RT-LAMP outer forward primer Yang_ORF1ab_F3 GTTACGATGGTGGCTGTA 14885 - 14902 ORF1ab GTTACGATGGTGGCTGTA 35
CoV2ID227 LAMP primer RT-LAMP outer backward primer Yang_ORF1ab_B3 CTCAAATGAATCTTAAGTATGCC 15059 - 15081 ORF1ab CTCAAATGAATCTTAAGTATGCC 35
CoV2ID228 LAMP primer RT-LAMP forward inner primer Yang_ORF1ab_FIP GCTAACCAAGTCATCGTCAATCCATTTAATAAATGGGGTAAGGCT 14952 - 14976 ORF1ab TCCATTTAATAAATGGGGTAAGGCT 35
CoV2ID229 LAMP primer RT-LAMP backward inner primer Yang_ORF1ab_BIP AATGAGTTATGAGGATCAAGATGCAACGTAATGTCATCCCTACTATAA 15035 - 15058 ORF1ab AACGTAATGTCATCCCTACTATAA 35
CoV2ID230 LAMP primer RT-LAMP loop forward primer Yang_ORF1ab_LF ACCTAGACAAATCAGCTGGT 14930 - 14949 ORF1ab ACCTAGACAAATCAGCTGGT 35
CoV2ID231 LAMP primer RT-LAMP loop backward primer Yang_ORF1ab_LB CTTTTCGCATATACAAA 15019 - 15035 ORF1ab CTTTTCGCATATACAAA 35
CoV2ID232 LAMP primer RT-LAMP outer forward primer Yang_E_F3 AGCTGATGAGTACGAACTT 26226 - 26244 E AGCTGATGAGTACGAACTT 35
CoV2ID233 LAMP primer RT-LAMP outer backward primer Yang_E_B3 ACTCTCGTGTTAAAAATCTGAA 26420 - 26441 E ACTCTCGTGTTAAAAATCTGAA 35
CoV2ID234 LAMP primer RT-LAMP forward inner primer Yang_E_FIP TTCGTTTCGGAAGAGACAGTACTTCTTTTTCTTGCTTTCGTGGT 26293 - 26318 E GTACTTCTTTTTCTTGCTTTCGTGGT 35
CoV2ID235 LAMP primer RT-LAMP backward inner primer Yang_E_BIP TTGCTAGTTACACTAGCCATCCTTACGTGAGTCTTGTAAAACCT 26387 - 26406 E ACGTGAGTCTTGTAAAACCT 35
CoV2ID236 LAMP primer RT-LAMP loop forward primer Yang_E_LF GTACGTTAATAGTTAATAGCG 26273 - 26293 E GTACGTTAATAGTTAATAGCG 35
CoV2ID237 LAMP primer RT-LAMP loop backward primer Yang_E_LB GCGCTTCGATTGTGTGC 26350 - 26366 E GCGCTTCGATTGTGTGC 35
CoV2ID238 LAMP primer RT-LAMP forward inner primer Yang_N_FIP CAATGCTGCAATCGTGCTACGCTTCTACGCAGAAGGGAGCA 28782 - 28802 N GCTTCTACGCAGAAGGGAGCA 35
CoV2ID239 LAMP primer RT-LAMP backward inner primer Yang_N_BIP GGCGGCAGTCAAGCCTCTTCAACTCCAGGCAGCAGTAGG 28861 - 28882 N TTCAACTCCAGGCAGCAGTAGG 35
CoV2ID240 LAMP primer RT-LAMP loop forward primer Yang_N_LF CTTCCTCAAGGAACAAC 28754 - 28770 N CTTCCTCAAGGAACAAC 35
CoV2ID241 LAMP primer RT-LAMP loop backward primer Yang_N_LB ACGTAGTCGCAACAGTTCAAGAAATT 28837 - 28862 N ACGTAGTCGCAACAGTTCAAGAAATT 35
CoV2ID242 LAMP primer RT-LAMP outer forward primer Orf1a-A-F3 CTGCACCTCATGGTCATGTT 498 - 517 ORF1ab CTGCACCTCATGGTCATGTT 36
CoV2ID243 LAMP primer RT-LAMP outer backward primer Orf1a-A-B3 AGCTCGTCGCCTAAGTCAA 693 - 711 ORF1ab TTGACTTAGGCGACGAGCT 36
CoV2ID244 LAMP primer RT-LAMP forward inner primer Orf1a-A-FIP GAGGGACAAGGACACCAAGTGTATGGTTGAGCTGGTAGCAGA 517 - 537 ORF1ab TATGGTTGAGCTGGTAGCAGA 36
CoV2ID245 LAMP primer RT-LAMP backward inner primer Orf1a-A-BIP CCAGTGGCTTACCGCAAGGTTTTAGATCGGCGCCGTAAC 669 - 687 ORF1ab GTTACGGCGCCGATCTAAA 36
CoV2ID246 LAMP primer RT-LAMP loop forward primer Orf1a-A-LF CCGTACTGAATGCCTTCGAGT 538 - 558 ORF1ab ACTCGAAGGCATTCAGTACGG 36
CoV2ID247 LAMP primer RT-LAMP loop backward primer Orf1a-A-LB TTCGTAAGAACGGTAATAAAGGAGC 633 - 657 ORF1ab TTCGTAAGAACGGTAATAAAGGAGC 36
CoV2ID248 LAMP primer RT-LAMP outer forward primer Orf1a-B-F3 TCATCAAACGTTCGGATGCT 474 - 493 ORF1ab TCATCAAACGTTCGGATGCT 36
CoV2ID249 LAMP primer RT-LAMP outer backward primer Orf1a-B-B3 TATGGCCACCAGCTCCTT 651 - 668 ORF1ab AAGGAGCTGGTGGCCATA 36
CoV2ID250 LAMP primer RT-LAMP forward inner primer Orf1a-B-FIP CGACCGTACTGAATGCCTTCGAGAACTGCACCTCATGGTCAT 495 - 514 ORF1ab GAACTGCACCTCATGGTCAT 36
CoV2ID251 LAMP primer RT-LAMP backward inner primer Orf1a-B-BIP AGACACTTGGTGTCCTTGTCCCAGAAGAACCTTGCGGTAAGC 614 - 633 ORF1ab GCTTACCGCAAGGTTCTTCT 36
CoV2ID252 LAMP primer RT-LAMP loop forward primer Orf1a-B-LF CTGCTACCAGCTCAACCATAAC 515 - 536 ORF1ab GTTATGGTTGAGCTGGTAGCAG 36
CoV2ID253 LAMP primer RT-LAMP loop backward primer Orf1a-B-LB TCATGTGGGCGAAATACCAGT 592 - 612 ORF1ab TCATGTGGGCGAAATACCAGT 36
CoV2ID254 LAMP primer RT-LAMP outer backward primer Orf1a-C-B3 GATCAGTGCCAAGCTCGTC 704 - 722 ORF1ab GACGAGCTTGGCACTGATC 36
CoV2ID255 LAMP primer RT-LAMP forward inner primer Orf1a-C-FIP GAGGGACAAGGACACCAAGTGTGGTAGCAGAACTCGAAGGC 528 - 547 ORF1ab TGGTAGCAGAACTCGAAGGC 36
CoV2ID256 LAMP primer RT-LAMP loop forward primer Orf1a-C-LF ACCACTACGACCGTACTGAAT 548 - 568 ORF1ab ATTCAGTACGGTCGTAGTGGT 36
CoV2ID257 LAMP primer RT-LAMP outer forward primer Zhu_Orf1ab_F3 GGATTTTGTGACTTAAAAGGTAAG 13286 - 13309 ORF1ab GGATTTTGTGACTTAAAAGGTAAG 37
CoV2ID258 LAMP primer RT-LAMP outer backward primer Zhu_Orf1ab_B3 GGTTTGCGGTGTAAGTGCAGCCCGT 13470 - 13494 ORF1ab GGTTTGCGGTGTAAGTGCAGCCCGT 37
CoV2ID259 LAMP primer RT-LAMP forward inner primer Zhu_Orf1ab_FIP TGTACAAATACCTACAACTTGTGACACTTAAAAACACAGTCTGTACCG 13355 - 13379 ORF1ab ACACTTAAAAACACAGTCTGTACCG 37
CoV2ID260 LAMP primer RT-LAMP backward inner primer Zhu_Orf1ab_BIP TCTGCGGTATGTGGAAAGGTTATGCTGATGCACAATCGTTT 13445 - 13462 ORF1ab GCTGATGCACAATCGTTT 37
CoV2ID261 LAMP primer RT-LAMP loop forward primer Zhu_Orf1ab_LF CTAATGACCCTGTGGGTTT 13335 - 13353 ORF1ab CTAATGACCCTGTGGGTTT 37
CoV2ID262 LAMP primer RT-LAMP loop backward primer Zhu_Orf1ab_LB GAACCCATGCTTCAGTC 13427 - 13443 ORF1ab GAACCCATGCTTCAGTC 37
CoV2ID263 LAMP primer RT-LAMP outer forward primer Zhu_N_F3 CTACCTAGGAACTGGGCC 28606 - 28623 N CTACCTAGGAACTGGGCC 37
CoV2ID264 LAMP primer RT-LAMP outer backward primer Zhu_N_B3 GGCAGTCAAGCCTCTTCT 28808 - 28825 N GGCAGTCAAGCCTCTTCT 37
CoV2ID265 LAMP primer RT-LAMP forward inner primer Zhu_N_FIP CCTATGGTGCTAACAAAGACTGAGGGAGCCTTGAATACACC 28676 - 28698 N ACTGAGGGAGCCTTGAATACACC 37
CoV2ID266 LAMP primer RT-LAMP backward inner primer Zhu_N_BIP AATCCTGCTAACAATGCTGCAATCCTACGCAGAAGGGAGCAG 28786 - 28803 N CTACGCAGAAGGGAGCAG 37
CoV2ID267 LAMP primer RT-LAMP loop forward primer Zhu_N_LF GCATCATATGGGTTGCAAC 28659 - 28677 N GCATCATATGGGTTGCAAC 37
CoV2ID268 LAMP primer RT-LAMP loop backward primer Zhu_N_LB CTTCCTCAAGGAACAACAT 28754 - 28772 N CTTCCTCAAGGAACAACAT 37
CoV2ID269 PCR primer RT-PCR PCR primer forward Amrane_S_F AAACTTGTGCCCTTTTGGTG 22561 - 22580 S AAACTTGTGCCCTTTTGGTG 38
CoV2ID270 PCR primer RT-PCR PCR primer reverse Amrane_S_R TGCTGATTCTCTTCCTGTTCC 22620 - 22640 S GGAACAGGAAGAGAATCAGCA 38
CoV2ID271 Probe RT-PCR Probe Amrane_S_P CGCCACCAGATTTGCATCTG 22591 - 22610 S CGCCACCAGATTTGCATCTG 38
CoV2ID272 PCR primer RT-PCR PCR primer forward Wu_For ATGGGTTGGGATTATCCTAAATGTGA 15283 - 15308 ORF1ab ATGGGTTGGGATTATCCTAAATGTGA 39
CoV2ID273 PCR primer RT-PCR PCR primer reverse Wu_Rev AGCAGTTGTGGCATCTCCTGATGAG 15480 - 15504 ORF1ab CTCATCAGGAGATGCCACAACTGCT 39
CoV2ID274 Probe RT-PCR Probe MGB Probe ATGCTTAGAATTATGGCCTCAC 15325 - 15346 ORF1ab ATGCTTAGAATTATGGCCTCAC 39
CoV2ID275 PCR primer RT-PCR PCR primer forward short_N_spk_2_F AAGACGGCATCATATGGGTTGC 28653 - 28674 N AAGACGGCATCATATGGGTTGC 40
CoV2ID276 PCR primer RT-PCR PCR primer reverse short_N_spk_1_R GGCAATGTTGTTCCTTGAGGAAG 28754 - 28776 N CTTCCTCAAGGAACAACATTGCC 40
CoV2ID277 LAMP primer RT-LAMP outer forward primer Yu_orf1ab_F3 CCACTAGAGGAGCTACTGTA 15182 - 15201 ORF1ab CCACTAGAGGAGCTACTGTA 41
CoV2ID278 LAMP primer RT-LAMP outer backward primer Yu_orf1ab_B3 TGACAAGCTACAACACGT 15370 - 15387 ORF1ab ACGTGTTGTAGCTTGTCA 41
CoV2ID279 LAMP primer RT-LAMP forward inner primer Yu_orf1ab_FIP AGGTGAGGGTTTTCTACATCACTATATTGGAACAAGCAAATTCTATGG 15205 - 15227 ORF1ab ATTGGAACAAGCAAATTCTATGG 41
CoV2ID280 LAMP primer RT-LAMP backward inner primer Yu_orf1ab_BIP ATGGGTTGGGATTATCCTAAATGTGTGCGAGCAAGAACAAGTG 15344 - 15361 ORF1ab CACTTGTTCTTGCTCGCA 41
CoV2ID281 LAMP primer RT-LAMP loop forward primer Yu_orf1ab_LF CAGTTTTTAACATGTTGTGCCAACC 15229 - 15253 ORF1ab GGTTGGCACAACATGTTAAAAACTG 41
CoV2ID282 LAMP primer RT-LAMP loop backward primer Yu_orf1ab_LB ATAGAGCCATGCCTAACATGCTT 15308 - 15330 ORF1ab ATAGAGCCATGCCTAACATGCTT 41
CoV2ID283 PCR primer RT-PCR PCR primer forward M-475-F TGTGACATCAAGGACCTGCC 26997 - 27016 M TGTGACATCAAGGACCTGCC 42
CoV2ID284 PCR primer RT-PCR PCR primer reverse M-574-R CTGAGTCACCTGCTACACGC 27077 - 27096 M GCGTGTAGCAGGTGACTCAG 42
CoV2ID285 Probe RT-PCR Probe M-507-P TGTTGCTACATCACGAACGC 27029 - 27048 M TGTTGCTACATCACGAACGC 42
CoV2ID286 PCR primer RT-PCR PCR primer forward S-1850-F GCACAGAAGTCCCTGTTGCT 23412 - 23431 S GCACAGAAGTCCCTGTTGCT 42
CoV2ID287 PCR primer RT-PCR PCR primer reverse S-1949-R AAACAGCCTGCACGTGTTTG 23492 - 23511 S CAAACACGTGCAGGCTGTTT 42
CoV2ID288 Probe RT-PCR Probe S-1884-P ACTTACTCCTACTTGGCGTGT 23446 - 23466 S ACTTACTCCTACTTGGCGTGT 42
CoV2ID289 LAMP primer RT-LAMP outer forward primer S1-F3 AGTTTGAGCCATCAACTCA 3084 - 3102 ORF1ab AGTTTGAGCCATCAACTCA 43
CoV2ID290 LAMP primer RT-LAMP outer backward primer S1-B3 TGAACCTCAACAATTGTTTGA 3271 - 3291 ORF1ab TCAAACAATTGTTGAGGTTCA 43
CoV2ID291 LAMP primer RT-LAMP forward inner primer S1-F1P CAGGTTGAAGAGCAGCAGAAGTGTACTGAAGATGATTACCAAGG 3114 - 3135 ORF1ab GTACTGAAGATGATTACCAAGG 43
CoV2ID292 LAMP primer RT-LAMP backward inner primer S1-B1P AGCAAGAAGAAGATTGGTTAGATGATGTCTGATTGTCCTCACTG 3244 - 3262 ORF1ab CAGTGAGGACAATCAGACA 43
CoV2ID293 LAMP primer RT-LAMP loop forward primer S1-LPF GGCACCAAATTCCAAAGGT 3139 - 3157 ORF1ab ACCTTTGGAATTTGGTGCC 43
CoV2ID294 LAMP primer RT-LAMP loop backward primer S1-LPB AACTGTTGGTCAACAAGACGG 3223 - 3243 ORF1ab AACTGTTGGTCAACAAGACGG 43
CoV2ID295 LAMP primer RT-LAMP outer forward primer S2-F3 ATTCTAAGCACACGCCTAT 22173 - 22191 S ATTCTAAGCACACGCCTAT 43
CoV2ID296 LAMP primer RT-LAMP outer backward primer S2-B3 GAAGATAACCCACATAATAAGCT 22351 - 22373 S AGCTTATTATGTGGGTTATCTTC 43
CoV2ID297 LAMP primer RT-LAMP forward inner primer S2-F1P ACCTATTGGCAAATCTACCAATGGTTTAGTGCGTGATCTCCCT 22195 - 22213 S TTTAGTGCGTGATCTCCCT 43
CoV2ID298 LAMP primer RT-LAMP backward inner primer S2-B1P ATCACTAGGTTTCAAACTTTACTTGCCTGTCCAACCTGAAGAAGA 22322 - 22140 S TCTTCTTCAGGTTGGACAG 43
CoV2ID299 LAMP primer RT-LAMP loop forward primer S2-LPF TTCTAAAGCCGAAAAACCCTG 22214 - 22234 S CAGGGTTTTTCGGCTTTAGAA 43
CoV2ID300 LAMP primer RT-LAMP loop backward primer S2-LPB CATAGAAGTTATTTGACTCCTGGTG 22295 - 22319 S CATAGAAGTTATTTGACTCCTGGTG 43
CoV2ID301 LAMP primer RT-LAMP outer forward primer S3-F3 CACCTTATGGGTTGGGATT 15277 - 15295 ORF1ab CACCTTATGGGTTGGGATT 43
CoV2ID302 LAMP primer RT-LAMP outer backward primer S3-B3 AACATATAGTGAACCGCCA 15447 - 15465 ORF1ab TGGCGGTTCACTATATGTT 43
CoV2ID303 LAMP primer RT-LAMP forward inner primer S3-F1P GTTTGCGAGCAAGAACAAGTGAATGTGATAGAGCCATGCC 15302 - 15320 ORF1ab AATGTGATAGAGCCATGCC 43
CoV2ID304 LAMP primer RT-LAMP backward inner primer S3-B1P ATACAACGTGTTGTAGCTTGTCACACATGACCATTTCACTCAA 15427 - 15448 ORF1ab TTGAGTGAAATGGTCATGTGTG 43
CoV2ID305 LAMP primer RT-LAMP loop forward primer S3-LPF GGCCATAATTCTAAGCATGTTA 15321 - 15342 ORF1ab TAACATGCTTAGAATTATGGCC 43
CoV2ID306 LAMP primer RT-LAMP loop backward primer S3-LPB ATTAGCTAATGAGTGTGCTCAAGTA 15402 - 15426 ORF1ab ATTAGCTAATGAGTGTGCTCAAGTA 43
CoV2ID307 LAMP primer RT-LAMP outer forward primer S4-F3 ACATGCTTAGAATTATGGCC 15323 - 15342 ORF1ab ACATGCTTAGAATTATGGCC 43
CoV2ID308 LAMP primer RT-LAMP outer backward primer S4-B3 GCTTGACAAATGTTAAAAACACT 15514 - 15536 ORF1ab AGTGTTTTTAACATTTGTCAAGC 43
CoV2ID309 LAMP primer RT-LAMP forward inner primer S4-F1P TTGAGCACACTCATTAGCTAATCTATCACTTGTTCTTGCTCGCA 15343 - 15361 ORF1ab TCACTTGTTCTTGCTCGCA 43
CoV2ID310 LAMP primer RT-LAMP backward inner primer S4-B1P GAGTGAAATGGTCATGTGTGGCGCATAAGCAGTTGTGGCA 15492 - 15509 ORF1ab TGCCACAACTGCTTATGC 43
CoV2ID311 LAMP primer RT-LAMP loop forward primer S4-LPF GACAAGCTACAACACGTTGTATGT 15363 - 15386 ORF1ab ACATACAACGTGTTGTAGCTTGTC 43
CoV2ID312 LAMP primer RT-LAMP loop backward primer S4-LPB ACTATATGTTAAACCAGGTGGAACC 15456 - 15480 ORF1ab ACTATATGTTAAACCAGGTGGAACC 43
CoV2ID313 LAMP primer RT-LAMP outer forward primer S5-F3 ATGGCCTCACTTGTTCTT 15337 - 15354 ORF1ab ATGGCCTCACTTGTTCTT 43
CoV2ID314 LAMP primer RT-LAMP outer backward primer S5-B3 TAACATTGGCCGTGACAG 15536 - 15553 ORF1ab CTGTCACGGCCAATGTTA 43
CoV2ID315 LAMP primer RT-LAMP forward inner primer S5-F1P TTGAGCACACTCATTAGCTAATCTATGCTCGCAAACATACAACG 15354 - 15372 ORF1ab TGCTCGCAAACATACAACG 43
CoV2ID316 LAMP primer RT-LAMP backward inner primer S5-B1P GTCATGTGTGGCGGTTCACTACACTATTAGCATAAGCAGTTG 15497 - 15518 ORF1ab CAACTGCTTATGCTAATAGTGT 43
CoV2ID317 LAMP primer RT-LAMP loop forward primer S5-LPF ACGGTGTGACAAGCTACAACA 15373 - 15393 ORF1ab TGTTGTAGCTTGTCACACCGT 43
CoV2ID318 LAMP primer RT-LAMP loop backward primer S5-LPB CCAGGTGGAACCTCATCAGGAG 15469- 15490 ORF1ab CCAGGTGGAACCTCATCAGGAG 43
CoV2ID319 PCR primer RT-PCR PCR primer forward Smyrlaki_N1_F GACCCCAAAATCAGCGAA 28287 - 28304 N GACCCCAAAATCAGCGAA 44
CoV2ID320 PCR primer RT-PCR PCR primer forward Smyrlaki_E_F GGAAGAGACAGGTACGTTAATA 26262 - 26283 E GGAAGAGACAGGTACGTTAATA 44
CoV2ID321 PCR primer RT-PCR PCR primer reverse Smyrlaki_E_R AGCAGTACGCACACAATCGAA 26354 - 26374 E TTCGATTGTGTGCGTACTGCT 44
CoV2ID322 PCR primer RT-PCR PCR primer forward Smyrlaki_RdRP_F GTCATGTGTGGCGGTTCACT 15439 - 15458 ORF1ab GTCATGTGTGGCGGTTCACT 44
CoV2ID323 PCR primer RT-PCR PCR primer reverse Smyrlaki_RdRP_R CAACACTATTAGCATAAGCAGTTGT 15519 - 15496 ORF1ab ACAACTGCTTATGCTAATAGTGTT 44
CoV2ID324 PCR primer RT-PCR PCR primer forward Li_S_F TGTACTTGGACAATCAAAAAGAGTTGAT 24658 - 24685 S TGTACTTGGACAATCAAAAAGAGTTGAT 45
CoV2ID325 PCR primer RT-PCR PCR primer reverse Li_S_R AGGAGCAGTTGTGAAGTTCTTTTC 24776 - 24799 S GAAAAGAACTTCACAACTGCTCCT 45
CoV2ID326 gRNA CRISPR gRNA N-gene gRNA #1 UAAUUUCUACUAAGUGUAGAUCCCCCAGCGCUUCAGCGUUC 29196 - 29215 N CCCCCAGCGCTTCAGCGTTC 10
CoV2ID327 gRNA CRISPR gRNA E-gene gRNA #2 UAAUUUCUACUAAGUGUAGAUGUGGUAUUCUUGCUAGUUAC 26314 - 26333 E GTGGTATTCTTGCTAGTTAC 10
CoV2ID328 gRNA CRISPR gRNA N-gene gRNA #2 UAAUUUCUACUAAGUGUAGAUGCAAUGUUGUUCCUUGAGGA 28756 - 28775 N TCCTCAAGGAACAACATTGC 10
CoV2ID329 gRNA CRISPR gRNA E-gene gRNA #1 UAAUUUCUACUAAGUGUAGAUUUGCUUUCGUGGUAUUCUUG 26306 - 26325 E TTGCTTTCGTGGTATTCTTG 10
CoV2ID330 PCR primer Nested PCR PCR primer forward SARS-CoV-2-15283-F ATGGGTTGGGATTATCCTAAATG 15283 - 15305 ORF1ab ATGGGTTGGGATTATCCTAAATG 46
CoV2ID331 PCR primer Nested PCR PCR primer reverse SARS-CoV-2-15887-R TGTTGAGAGCAAAATTCATG 15868 - 15887 ORF1ab CATGAATTTTGCTCTCAACA 46
CoV2ID332 PCR primer Nested PCR PCR primer forward SARS-CoV-2-15286-F GGTTGGGATTATCCTAAATGTGA 15286 - 15308 ORF1ab GGTTGGGATTATCCTAAATGTGA 46
CoV2ID333 PCR primer Nested PCR PCR primer reverse SARS-CoV-2-15725-R GCATCGTCAGAGAGTATCATCAT 15703 - 15725 ORF1ab ATGATGATACTCTCTGACGATGC 46
CoV2ID334 PCR primer RT-PCR PCR primer forward Wuhan-TM2020For TCGTGCTACAACTTCCTCAAG 28743 - 28763 N TCGTGCTACAACTTCCTCAAG 47
CoV2ID335 PCR primer RT-PCR PCR primer probe Wuhan-TM2020Probe CCGCCTCTGCTCCCTTCTGC 28790 - 28809 N GCAGAAGGGAGCAGAGGCGG 47
CoV2ID336 PCR primer RT-PCR PCR primer reverse SARS2-28875R-G CTGCCTGGAGTTGAATTTCTTG 28854 - 28875 N CAAGAAATTCAACTCCAGGCAG 47
CoV2ID337 PCR primer RT-PCR PCR primer reverse SARS2-28875R-A CTGCCTGGAGTTGAATTTCTTA 28854-28875 N CAAGAAATTCAACTCCAGGCAG 47
CoV2ID338 LAMP primer RT-LAMP outer forward primer ORF7a-F3 TCTTGGCACTGATAACACTC 27410 - 27429 ORF7a TCTTGGCACTGATAACACTC 48
CoV2ID339 LAMP primer RT-LAMP outer backward primer ORF7a-B3 GATCTGGCACGTAACTGAT 27617 - 27635 ORF7a ATCAGTTACGTGCCAGATC 48
CoV2ID340 LAMP primer RT-LAMP forward inner primer ORF7a-FIP TCCAGAAGAGCAAGGTTCTTTTAAAGCTACTTGTGAGCTTTATCACT 27430 - 27451 ORF7a GCTACTTGTGAGCTTTATCACT 48
CoV2ID341 LAMP primer RT-LAMP backward inner primer ORF7a-BIP AGCTGATAACAAATTTGCACTGACGTTTTACGCCGTCAGGAC 27593 - 27610 ORF7a GTCCTGACGGCGTAAAAC 48
CoV2ID342 LAMP primer RT-LAMP loop forward primer ORF7a-LF GTTGTACCTCTAACACACTCTTGGT 27452 - 27476 ORF7a ACCAAGAGTGTGTTAGAGGTACAAC 48
CoV2ID343 LAMP primer RT-LAMP loop backward primer ORF7a-LB GCTTTAGCACTCAATTTGCTTTTGC 27566 - 27590 ORF7a GCTTTAGCACTCAATTTGCTTTTGC 48
CoV2ID344 LAMP primer RT-LAMP outer forward primer M-GENE-F3 AGTAATAGGTTTCCTATTCCTTAC 26588 - 26611 M AGTAATAGGTTTCCTATTCCTTAC 48
CoV2ID345 LAMP primer RT-LAMP outer backward primer M-GENE-B3 AGCCACATCAAGCCTACA 26783 - 26800 M TGTAGGCTTGATGTGGCT 48
CoV2ID346 LAMP primer RT-LAMP forward inner primer M-GENE-FIP GCCATAACAGCCAGACCAAAATTAATGGATTTGTCTTCTACAATTTGC 26613 - 26635 M ATGGATTTGTCTTCTACAATTTGC 48
CoV2ID347 LAMP primer RT-LAMP backward inner primer M-GENE-BIP TTAGCTTGTTTTGTGCTTGCTGACAAGCCATTGCGATAGC 267763 - 26780 M GCTATCGCAATGGCTTGT 48
CoV2ID348 LAMP primer RT-LAMP loop forward primer M-GENE-LF CAAAAACCTATTCCTGTTGGCATAG 26636 - 26660 M CTATGCCAACAGGAATAGGTTTTTG 48
CoV2ID349 LAMP primer RT-LAMP loop backward primer M-GENE-LB CAGAATAAATTGGATCACCGGTGGA 26735 - 26759 M CAGAATAAATTGGATCACCGGTGGA 48
CoV2ID350 LAMP primer RT-LAMP loop backward primer M-GENE-LB-2 GAATAAATTGGATCACCGGTGGA 26737 - 26759 M GAATAAATTGGATCACCGGTGGA 48
CoV2ID351 LAMP primer RT-LAMP outer forward primer ORF3a-A-F3 CACTTCAGACTATTACCAGCT 26013 - 26033 ORF3a CACTTCAGACTATTACCAGCT 48
CoV2ID352 LAMP primer RT-LAMP outer backward primer ORF3a-A-B3 GCTTGTGCTTACAAAGGC 26211 - 26228 ORF3a GCCTTTGTAAGCACAAGC 48
CoV2ID353 LAMP primer RT-LAMP forward inner primer ORF3a-A-FIP GTTCTTCAGGCTCATCAACAATTTTCTCAACTCAATTGAGTACAGACA 26037 - 26059 ORF3a CTCAACTCAATTGAGTACAGACA 48
CoV2ID354 LAMP primer RT-LAMP backward inner primer ORF3a-A-BIP CCAAATTCACACAATCGACGGTTTAGTAGTCGTCGTCGGTT 26189 - 26206 ORF3a AACCGACGACGACTACTA 48
CoV2ID355 LAMP primer RT-LAMP loop forward primer ORF3a-A-LF TGAAGAAGGTAACATGTTCAACACC 26062 - 26086 ORF3a GGTGTTGAACATGTTACCTTCTTCA 48
CoV2ID356 LAMP primer RT-LAMP loop backward primer ORF3a-A-LB CGGAGTTGTTAATCCAGTAATGGAA 26151 - 26175 ORF3a CGGAGTTGTTAATCCAGTAATGGAA 48
CoV2ID357 LAMP primer RT-LAMP outer forward primer ORF3a-B-F3 ATTTTGTTCGCGCTACTG 25472 - 25489 ORF3a ATTTTGTTCGCGCTACTG 48
CoV2ID358 LAMP primer RT-LAMP outer backward primer ORF3a-B-B3 ACGAGCAAAAGGTGTGAG 25665 - 25682 ORF3a CTCACACCTTTTGCTCGT 48
CoV2ID359 LAMP primer RT-LAMP forward inner primer ORF3a-B-FIP CTCTGAAAAACAGCAAGAAGAGCAAGATACCGATACAAGCCTCAC 25494- 25513 ORF3a GATACCGATACAAGCCTCAC 48
CoV2ID360 LAMP primer RT-LAMP backward inner primer ORF3a-B-BIP TAACCCTCAAAAAGAGATGGCAACAAACAACAACAGCAAGTTG 25635 - 25654 ORF3a CAACTTGCTGTTGTTGTTTG 48
CoV2ID361 LAMP primer RT-LAMP loop forward primer ORF3a-B-LF ACAATAAGCCATCCGAAAGGGA 25514 - 25535 ORF3a TCCCTTTCGGATGGCTTATTGT 48
CoV2ID362 LAMP primer RT-LAMP loop backward primer ORF3a-B-LB CACTCTCCAAGGGTGTTCACT 25607 - 25627 ORF3a CACTCTCCAAGGGTGTTCACT 48
CoV2ID363 LAMP primer RT-LAMP forward inner primer GENE-N-T7-FIP TCTGGCCCAGTTCCTAGGTAGTTAATACGACTCACTATAGGCCAGACGAATTCGTGGTGG 28545 - 28563 N CCAGACGAATTCGTGGTGG 48
CoV2ID364 LAMP primer RT-LAMP forward inner primer ORF7-T7-FIP TCCAGAAGAGCAAGGTTCTTTTAAATAATACGACTCACTATAGGGCTACTTGTGAGCTTTATCACT 27430 - 27451 ORF7 GCTACTTGTGAGCTTTATCACT 48
CoV2ID365 LAMP primer RT-LAMP forward inner primer ORF3a-A-T7-FIP GTTCTTCAGGCTCATCAACAATTTTTAATACGACTCACTATAGGGCTCAACTCAATTGAGTACAGACA 26037 - 26059 ORF3a CTCAACTCAATTGAGTACAGACA 48
CoV2ID366 gRNA CRISPR gRNA Schermer_Orf1ab GATTTAGACTACCCCAAAAACGAAGGGGACTAAAACCCAACCTCTTCTGTAATTTTTAAACTAT 6510 - 6537 ORF1ab ATAGTTTAAAAATTACAGAAGAGGTTGG 48
CoV2ID367 gRNA CRISPR gRNA Schermer_S Gene GATTTAGACTACCCCAAAAACGAAGGGGACTAAAACGCAGCACCAGCTGTCCAACCTGAAGAAG 22323 - 22350 S CTTCTTCAGGTTGGACAGCTGGTGCTGC 48
CoV2ID368 gRNA CRISPR gRNA Schermer_Gene-N GATTTAGACTACCCCAAAAACGAAGGGGACTAAAACTTGTTAGCACCATAGGGAAGTCCAGCTT 28626 - 28653 N AAGCTGGACTTCCCTATGGTGCTAACAA 48
CoV2ID369 gRNA CRISPR gRNA Schermer_Orf7 GATTTAGACTACCCCAAAAACGAAGGGGACTAAAACGGATGAAATGGTGAATTGCCCTCGTATG 27509 - 27535 ORF7 CATACGAGGGCAATTCACCATTTCATCC 48
CoV2ID370 gRNA CRISPR gRNA Schermer_Orf3 GATTTAGACTACCCCAAAAACGAAGGGGACTAAAACTGTGAATTTGGACATGTTCTTCAGGCTC 26107 - 26134 ORF3 GAGCCTGAAGAACATGTCCAAATTCACA 48
CoV2ID371 RPA primer RT-RPA RPA forward primer Orf1ab-Fw_v1 GAAATTAATACGACTCACTATAGGGCGAAGTTGTAGGAGACATTATACTTAAACC 6472 - 6501 ORF1ab CGAAGTTGTAGGAGACATTATACTTAAACC 48
CoV2ID372 RPA primer RT-RPA RPA reverse primer Orf1ab-Rev_v1 TAGTAAGACTAGAATTGTCTACATAAGCAGC 6554 - 6584 ORF1ab GCTGCTTATGTAGACAATTCTAGTCTTACTA 48
CoV2ID373 RPA primer RT-RPA RPA forward primer S-RPA-Fw_v1 GAAATAATACGACTCACTATAGGGAGGTTTCAAACTTTACTTGCTTTACATAGA 22271 - 22300 S AGGTTTCAAACTTTACTTGCTTTACATAGA 48
CoV2ID374 RPA primer RT-RPA RPA reverse primer S-RPA-Rev_v1 TCCTAGGTTGAAGATAACCCACATAATAAG 22353 - 22382 S CTTATTATGTGGGTTATCTTCAACCTAGGA 48
CoV2ID375 PCR primer RT-PCR PCR primer forward Li_orf1ab_F TGATGATACTCTCTGACGATGCTGT 15704 - 15728 ORF1ab TGATGATACTCTCTGACGATGCTGT 49
CoV2ID376 PCR primer RT-PCR PCR primer reverse Li_orf1ab_R CTCAGTCCAACATTTTGCTTCAGA 15823 - 15846 ORF1ab TCTGAAGCAAAATGTTGGACTGAG 49
CoV2ID377 PCR primer RT-PCR Probe Li_orf1ab_P ATGCATCTCAAGGTCTAGTG 15749 - 15768 ORF1ab ATGCATCTCAAGGTCTAGTG 49
CoV2ID378 PCR primer RT-PCR PCR primer forward BTstin_ORF1ab_F GGATCAAGAATCCTTTGGTGG 13213 - 13233 ORF1ab GGATCAAGAATCCTTTGGTGG 50
CoV2ID379 PCR primer RT-PCR PCR primer reverse BTstin_ORF1ab_R GTCACAAAATCCTTTAGGATTTGGA 13273 - 13297 ORF1ab TCCAAATCCTAAAGGATTTTGTGAC 50
CoV2ID380 PCR primer RT-PCR Probe BTstin_ORF1ab_P CATCGTGTTGTCTGTACTGCCGTTGCC 13236 - 13262 ORF1ab CATCGTGTTGTCTGTACTGCCGTTGCC 50
CoV2ID381 PCR primer PCR PCR primer forward WHCV-F1 CCAGGTAACAAACCAACCAACTT 20 -42 - CCAGGTAACAAACCAACCAACTT 51
CoV2ID382 PCR primer PCR PCR primer reverse WHCV-R1 GGCAACCAACATAAGAGAACACAC 1491 - 1514 ORF1ab GTGTGTTCTCTTATGTTGGTTGCC 51
CoV2ID383 PCR primer PCR PCR primer forward WHCV-F2 CAACCAAATGTGCCTTTCAACTC 1201 - 1223 ORF1ab CAACCAAATGTGCCTTTCAACTC 51
CoV2ID384 PCR primer PCR PCR primer reverse WHCV-R2 CACAGTGTCATCACCAAAAGTAACCT 2730 - 2755 ORF1ab AGGTTACTTTTGGTGATGACACTGTG 51
CoV2ID385 PCR primer PCR PCR primer forward WHCV-F3 TGTCACGCACTCAAAGGGATT 2392 - 2412 ORF1ab TGTCACGCACTCAAAGGGATT 51
CoV2ID386 PCR primer PCR PCR primer reverse WHCV-R3 GACAGCTAAGTAGACATTTGTGCGAA 3771 - 3796 ORF1ab TTCGCACAAATGTCTACTTAGCTGTC 51
CoV2ID387 PCR primer PCR PCR primer forward WHCV-F4 ATGCCATGCAAGTTGAATCTGAT 3507 - 3529 ORF1ab ATGCCATGCAAGTTGAATCTGAT 51
CoV2ID388 PCR primer PCR PCR primer reverse WHCV-R4 TGCGTGTGGAGGTTAATGTTGT 4989 - 5010 ORF1ab ACAACATTAACCTCCACACGCA 51
CoV2ID389 PCR primer PCR PCR primer forward WHCV-F5 GATCTCTCAAAGTGCCAGCTACAGT 4665 - 4689 ORF1ab GATCTCTCAAAGTGCCAGCTACAGT 51
CoV2ID390 PCR primer PCR PCR primer reverse WHCV-R5 TTATAATCAATAGCCACCACATCACC 6158 - 6183 ORF1ab GGTGATGTGGTGGCTATTGATTATAA 51
CoV2ID391 PCR primer PCR PCR primer forward WHCV-F6 AGAAACTTTGTATTGCATAGACGGTG 5791 - 5816 ORF1ab AGAAACTTTGTATTGCATAGACGGTG 51
CoV2ID392 PCR primer PCR PCR primer reverse WHCV-R6 ACCAGTACAGTAAGAAGGCATGCC 7037 - 7060 ORF1ab GGCATGCCTTCTTACTGTACTGGT 51
CoV2ID393 PCR primer PCR PCR primer forward WHCV-F7 GTTTAGCTGCTGTTAATAGTGTCCCTT 6642 - 6668 ORF1ab GTTTAGCTGCTGTTAATAGTGTCCCTT 51
CoV2ID394 PCR primer PCR PCR primer reverse WHCV-R7 TGCAACTTCCGCACTATCACC 8006 - 8026 ORF1ab GGTGATAGTGCGGAAGTTGCA 51
CoV2ID395 PCR primer PCR PCR primer forward WHCV-F8 TCCTACTGACCAGTCTTCTTACATCGT 7711 - 7737 ORF1ab TCCTACTGACCAGTCTTCTTACATCGT 51
CoV2ID396 PCR primer PCR PCR primer reverse WHCV-R8 TTTCACAAGTGCCGTGCCTAC 9216 - 9236 ORF1ab GTAGGCACGGCACTTGTGAAA 51
CoV2ID397 PCR primer PCR PCR primer forward WHCV-F9 GGTTTGCCTGGCACGATATTAC 8867 - 8888 ORF1ab GGTTTGCCTGGCACGATATTAC 51
CoV2ID398 PCR primer PCR PCR primer reverse WHCV-R9 ACTTAGGTGTCTTAGGATTGGCTGTAT 10329 - 10355 ORF1ab ATACAGCCAATCCTAAGACACCTAAGT 51
CoV2ID399 PCR primer PCR PCR primer forward WHCV-F10 TTGTCATCTCGCAAAGGCTCT 9958 - 9978 ORF1ab TTGTCATCTCGCAAAGGCTCT 51
CoV2ID400 PCR primer PCR PCR primer reverse WHCV-R10 GAGATTATAAGAGCCCACATGGAAA 11457 - 11481 ORF1ab TTTCCATGTGGGCTCTTATAATCTC 51
CoV2ID401 PCR primer PCR PCR primer forward WHCV-F11 GCTATGGGTATTATTGCTATGTCTGCT 11108 - 11134 ORF1ab GCTATGGGTATTATTGCTATGTCTGCT 51
CoV2ID402 PCR primer PCR PCR primer reverse WHCV-R11 TGGATTTCCCACAATGCTGAT 12541 - 12561 ORF1ab ATCAGCATTGTGGGAAATCCA 51
CoV2ID403 PCR primer PCR PCR primer forward WHCV-F12 CTGATCAAGCTATGACCCAAATGT 12279 - 12302 ORF1ab CTGATCAAGCTATGACCCAAATGT 51
CoV2ID404 PCR primer PCR PCR primer reverse WHCV-R12 GCAACAGCTGGACAATCCTTAAGT 13707 - 13730 ORF1ab ACTTAAGGATTGTCCAGCTGTTGC 51
CoV2ID405 PCR primer PCR PCR primer forward WHCV-F13 TCTGCGGTATGTGGAAAGGTTAT 13380 - 13402 ORF1ab TCTGCGGTATGTGGAAAGGTTAT 51
CoV2ID406 PCR primer PCR PCR primer reverse WHCV-R13 GTCAGCAGCATACACAAGTAATTCCT 14546 - 14571 ORF1ab AGGAATTACTTGTGTATGCTGCTGAC 51
CoV2ID407 PCR primer PCR PCR primer forward WHCV-F14 AGGGCTTTAACTGCAGAGTCACAT 14185 - 14208 ORF1ab AGGGCTTTAACTGCAGAGTCACAT 51
CoV2ID408 PCR primer PCR PCR primer reverse WHCV-R14 GCGGACATACTTATCGGCAATT 15582 - 15603 ORF1ab AATTGCCGATAAGTATGTCCGC 51
CoV2ID409 PCR primer PCR PCR primer forward WHCV-F15 TCAATAGCCGCCACTAGAGGAG 15172 - 15193 ORF1ab TCAATAGCCGCCACTAGAGGAG 51
CoV2ID410 PCR primer PCR PCR primer reverse WHCV-R15 TCACCAGCATTTGTCCAGTCAC 16571 - 16592 ORF1ab GTGACTGGACAAATGCTGGTGA 51
CoV2ID411 PCR primer PCR PCR primer forward WHCV-F16 TTGGGGCTTGTGTTCTTTGC 16241 - 16260 ORF1ab TTGGGGCTTGTGTTCTTTGC 51
CoV2ID412 PCR primer PCR PCR primer reverse WHCV-R16 CAAGCAGGGTTACGTGTAAGGAAT 17730 - 17753 ORF1ab ATTCCTTACACGTAACCCTGCTTG 51
CoV2ID413 PCR primer PCR PCR primer forward WHCV-F17 TGTCAATGCCAGATTACGTGCT 17394 - 17415 ORF1ab TGTCAATGCCAGATTACGTGCT 51
CoV2ID414 PCR primer PCR PCR primer reverse WHCV-R17 TAACAAAGCACTCGTGGACAGC 18880 - 18901 ORF1ab GCTGTCCACGAGTGCTTTGTTA 51
CoV2ID415 PCR primer PCR PCR primer forward WHCV-F18 TATGGGCACATGGCTTTGAGT 18593 - 18613 ORF1ab TATGGGCACATGGCTTTGAGT 51
CoV2ID416 PCR primer PCR PCR primer reverse WHCV-R18 TAAGAACACCATTACGGGCATTT 20025 - 20047 ORF1ab AAATGCCCGTAATGGTGTTCTTA 51
CoV2ID417 PCR primer PCR PCR primer forward WHCV-F19 TTGATGGACAACAGGGTGAAGTAC 19664 - 19687 ORF1ab TTGATGGACAACAGGGTGAAGTAC 51
CoV2ID418 PCR primer PCR PCR primer reverse WHCV-R19 CGAAGTGTCCCATGAGCTTATAAA 21197 - 21220 ORF1ab TTTATAAGCTCATGGGACACTTCG 51
CoV2ID419 PCR primer PCR PCR primer forward WHCV-F20 AGGAGTTGCACCAGGTACAGCT 20886 - 20907 ORF1ab AGGAGTTGCACCAGGTACAGCT 51
CoV2ID420 PCR primer PCR PCR primer reverse WHCV-R20 ACCCACATAATAAGCTGCAGCAC 22344 - 22366 S GTGCTGCAGCTTATTATGTGGGT 51
CoV2ID421 PCR primer PCR PCR primer forward WHCV-F21 CTATTAATTTAGTGCGTGATCTCCCTC 22188 - 22214 S CTATTAATTTAGTGCGTGATCTCCCTC 51
CoV2ID422 PCR primer PCR PCR primer reverse WHCV-R21 AAATTTGTGGGTATGGCAATAGAGTTA 23689 - 23715 S TAACTCTATTGCCATACCCACAAATTT 51
CoV2ID423 PCR primer PCR PCR primer forward WHCV-F22 ACTTACTCCTACTTGGCGTGTTTATTC 23446 - 23472 S ACTTACTCCTACTTGGCGTGTTTATTC 51
CoV2ID424 PCR primer PCR PCR primer reverse WHCV-R22 GCATTAATGCCAGAGATGTCACC 25061 - 25083 S GGTGACATCTCTGGCATTAATGC 51
CoV2ID425 PCR primer PCR PCR primer forward WHCV-F23 CTATCATCTTATGTCCTTCCCTCAGTC 24700 - 24726 S CTATCATCTTATGTCCTTCCCTCAGTC 51
CoV2ID426 PCR primer PCR PCR primer reverse WHCV-R23 TAGTCGTCGTCGGTTCATCATAAAT 26179 - 26203 ORF3a ATTTATGATGAACCGACGACGACTA 51
CoV2ID427 PCR primer PCR PCR primer forward WHCV-F24 TACTTCAGGTGATGGCACAACAA 25899 - 25921 ORF3a TACTTCAGGTGATGGCACAACAA 51
CoV2ID428 PCR primer PCR PCR primer reverse WHCV-R24 AAGCTCACAAGTAGCGAGTGTTATCA 27419 - 27444 ORF7a TGATAACACTCGCTACTTGTGAGCTT 51
CoV2ID429 PCR primer PCR PCR primer forward WHCV-F25 CGTGTAGCAGGTGACTCAGGTTT 27078 - 27100 M CGTGTAGCAGGTGACTCAGGTTT 51
CoV2ID430 PCR primer PCR PCR primer reverse WHCV-R25 TACCGTCACCACCACGAATTC 28551 - 28571 N GAATTCGTGGTGGTGACGGTA 51
CoV2ID431 PCR primer PCR PCR primer forward WHCV-F26 GGACCCCAAAATCAGCGAAAT 28286 - 28306 N GGACCCCAAAATCAGCGAAAT 51
CoV2ID432 PCR primer PCR PCR primer reverse WHCV-R26 AAAATCACATGGGGATAGCACTACT 29824 - 29848 - AGTAGTGCTATCCCCATGTGATTTT 51
CoV2ID433 PCR primer PCR PCR primer forward S1423F GCCGGTAGCACACCTTGTAA 22985 - 23004 S GCCGGTAGCACACCTTGTAA 51
CoV2ID434 PCR primer PCR PCR primer reverse S1736R2 GGATCACGGACAGCATCAGT 23279 - 23298 S ACTGATGCTGTCCGTGATCC 51
CoV2ID435 PCR primer PCR PCR primer forward S2620F ACTTCTGCACTGTTAGCGGG 24182 - 24201 S ACTTCTGCACTGTTAGCGGG 51
CoV2ID436 PCR primer PCR PCR primer reverse S3174R2 ATGAGGTGCTGACTGAGGGA 24717 - 24736 S TCCCTCAGTCAGCACCTCAT 51
CoV2ID437 PCR primer PCR PCR primer reverse S3240R1 GGCAGGAGCAGTTGTGAAGT 24783 - 24802 S ACTTCACAACTGCTCCTGCC 51
CoV2ID438 RACE primer RACE PCR 5-GSP CCACATGAGGGACAAGGACACCAAGTG 573 - 599 ORF1ab CACTTGGTGTCCTTGTCCCTCATGTGG 51
CoV2ID439 RACE primer RACE PCR 5-GSPn CATGACCATGAGGTGCAGTTCGAGC 491 - 515 ORF1ab GCTCGAACTGCACCTCATGGTCATG 51
CoV2ID440 RACE primer RACE PCR 3-GSP TGTCGCGCATTGGCATGGAAGTCACACC 29223 - 29250 N TGTCGCGCATTGGCATGGAAGTCACACC 51
CoV2ID441 RACE primer RACE PCR 3-GSPn CTCAAGCCTTACCGCAGAGACAGAAG 29409 - 29434 N CTCAAGCCTTACCGCAGAGACAGAAG 51
CoV2ID442 Target Generation primer Target Generation nsp10-Std-T7-F TAATACGACTCACTATAGGGGTGGGGGACAACCAATCACT 13122 - 13141 ORF1ab GTGGGGGACAACCAATCACT 52
CoV2ID443 Target Generation primer Target Generation nsp10-Std-R AGACGAGGTCTGCCATTGTG 13806 - 13825 ORF1ab CACAATGGCAGACCTCGTCT 52
CoV2ID444 Target Generation primer Target Generation RdRp-Std-T7-F TAATACGACTCACTATAGGGAATAGAGCTCGCACCGTAGC 15093 - 15113 ORF1ab GAATAGAGCTCGCACCGTAGC 52
CoV2ID445 Target Generation primer Target Generation RdRp-Std-R CATCTACAAAACAGCCGGCC 15957 - 15976 ORF1ab GGCCGGCTGTTTTGTAGATG 52
CoV2ID446 Target Generation primer Target Generation nsp14-Std-T7-F TAATACGACTCACTATAGGGTAGTGCTAAACCACCGCCTG 18447 - 18466 ORF1ab TAGTGCTAAACCACCGCCTG 52
CoV2ID447 Target Generation primer Target Generation nsp14-Std-R AACTGCCACCATCACAACCA 19275 - 19294 ORF1ab TGGTTGTGATGGTGGCAGTT 52
CoV2ID448 Target Generation primer Target Generation E-Std-T7-F TAATACGACTCACTATAGGGGCGTGCCTTTGTAAGCACAA 26207 - 26226 E GCGTGCCTTTGTAAGCACAA 52
CoV2ID449 Target Generation primer Target Generation E-Std-R GGCAGGTCCTTGATGTCACA 26997 - 27016 E TGTGACATCAAGGACCTGCC 52
CoV2ID450 Target Generation primer Target Generation N-Std-T7-F TAATACGACTCACTATAGGGGAATTGTGCGTGGATGAGGC 28068 - 28087 N GAATTGTGCGTGGATGAGGC 52
CoV2ID451 Target Generation primer Target Generation N-Std-R TGTCTCTGCGGTAAGGCTTG 29411 - 29430 N CAAGCCTTACCGCAGAGACA 52
CoV2ID452 LAMP primer RT-LAMP outer forward primer Rohaim_ORF1ab_F3 CCGCCACTAGAGGAGCTACT 15179 - 15198 ORF1ab CCGCCACTAGAGGAGCTACT 53
CoV2ID453 LAMP primer RT-LAMP outer backward primer Rohaim_ORF1ab_B3 TGTTGTAGCTTGTCACAC 15373 - 15390 ORF1ab TGTTGTAGCTTGTCACAC 53
CoV2ID454 LAMP primer RT-LAMP forward inner primer Rohaim_ORF1ab_FIP ATTGGAACAAGCAAATTCTATTATAGTGATGTAGAAAACCCTCACC 15255 - 15280 ORF1ab TTATAGTGATGTAGAAAACCCTCACC 53
CoV2ID455 LAMP primer RT-LAMP backward inner primer Rohaim_ORF1ab_BIP TATGGGTTGGGATTATCCTAAATGTGCCTCACTTGTTCTTGCTC 15340 - 15358 ORF1ab GCCTCACTTGTTCTTGCTC 53
CoV2ID456 LAMP primer RT-LAMP loop forward primer Rohaim_ORF1ab_LF GGTTGGCACAACATGTTAAAAAC 15229 - 15251 ORF1ab GGTTGGCACAACATGTTAAAAAC 53
CoV2ID457 LAMP primer RT-LAMP loop backward primer Rohaim_ORF1ab_LB AGCCATGCCTAACATGCTTAG 15312 - 15332 ORF1ab AGCCATGCCTAACATGCTTAG 53
CoV2ID458 PCR primer RT-PCR PCR primer forward Rohaim_RdRP_F GTGAAATGGTCATGTGTGGCGG 15431 - 15452 ORF1ab GTGAAATGGTCATGTGTGGCGG 53
CoV2ID459 PCR primer RT-PCR PCR primer reverse Rohaim_RdRP_R TATGCTAATAGTGTTTTTAACATTTG 15505 - 15530 ORF1ab TATGCTAATAGTGTTTTTAACATTTG 53
CoV2ID460 RPA primer RT-RPA RPA forward primer S-RPA-Forward_v1 GAAATTAATACGACTCACTATAGGGAGGTTTCAAACTTTACTTGCTT TACATAGA 22271 - 22300 S AGGTTTCAAACTTTACTTGCTTTACATAGA 54
CoV2ID461 RPA primer RT-RPA RPA forward primer Orf1ab-RPA-Forward_v1 GAAATTAATACGACTCACTATAGGGCGAAGTTGTAGGAGACATTAT ACTTAAACC 6472 - 6501 ORF1ab CGAAGTTGTAGGAGACATTATACTTAAACC 54
CoV2ID462 sgRNA CRISPR sgRNA nCoV-RdRp-sgRNA R ATGTGTGGCGGTTCACTATATGTatctacacttagtagaaatta 15442 - 15464 RdRp ATGTGTGGCGGTTCACTATATGT 55
CoV2ID463 sgRNA CRISPR sgRNA nCoV-ORF1b-sgRNA R TGGTTGCTTTGTAGGTTACCTGTatctacacttagtagaaatta 18787 - 18809 ORF1b ACAGGTAACCTACAAAGCAACCA 55
CoV2ID464 sgRNA CRISPR sgRNA nCOV-ORF1ab-sgRNA R GTCTGTACCGTCTGCGGTATGTGatctacacttagtagaaatta 13370 - 13392 ORF1ab GTCTGTACCGTCTGCGGTATGTG 55
CoV2ID465 PCR primer PCR PCR primer forward SARS-CoV-2_IBS_RdRP1_F CATGTGTGGCGGTTCACTAT 15441 - 15460 RdRp CATGTGTGGCGGTTCACTAT 56
CoV2ID466 PCR primer PCR PCR primer reverse SARS-CoV-2_IBS_RdRP1_R TGCATTAACATTGGCCGTGA 15539 - 15558 RdRp TCACGGCCAATGTTAATGCA 56
CoV2ID467 PCR primer PCR PCR primer forward SARS-CoV-2_IBS_S1_F CTACATGCACCAGCAACTGT 23114 - 23133 S CTACATGCACCAGCAACTGT 56
CoV2ID468 PCR primer PCR PCR primer reverse SARS-CoV-2_IBS_S1_R CACCTGTGCCTGTTAAACCA 23194 - 23213 S TGGTTTAACAGGCACAGGTG 56
CoV2ID469 PCR primer PCR PCR primer forward SARS-CoV-2_IBS_E1_F TTCGGAAGAGACAGGTACGTT 26259 - 26279 E TTCGGAAGAGACAGGTACGTT 56
CoV2ID470 PCR primer PCR PCR primer reverse SARS-CoV-2_IBS_E1_R CACACAATCGATGCGCAGTA 26349 - 26365 E TGCGCTTCGATTGTGTG 56
CoV2ID471 PCR primer PCR PCR primer forward SARS-CoV-2_IBS_N1_F CAATGCTGCAATCGTGCTAC 28732 - 28751 N CAATGCTGCAATCGTGCTAC 56
CoV2ID472 PCR primer PCR PCR primer reverse SARS-CoV-2_IBS_N1_R GTTGCGACTACGTGATGAGG 28830 - 28849 N CCTCATCACGTAGTCGCAAC 56
CoV2ID473 PCR primer PCR PCR primer forward SARS-CoV-2_IBS_RdRP2_F AGAATAGAGCTCGCACCGTA 15092 - 15111 RdRp AGAATAGAGCTCGCACCGTA 56
CoV2ID474 PCR primer PCR PCR primer reverse SARS-CoV-2_IBS_RdRP2_R CTCCTCTAGTGGCGGCTATT 15174 -15193 RdRp AATAGCCGCCACTAGAGGAG 56
CoV2ID475 PCR primer PCR PCR primer forward SARS-CoV-2_IBS_RdRP3_F TCTGTGATGCCATGCGAAAT 14015 - 14034 RdRp TCTGTGATGCCATGCGAAAT 56
CoV2ID476 PCR primer PCR PCR primer reverse SARS-CoV-2_IBS_RdRP3_R ACTACCTGGCGTGGTTTGTA 14108 - 14127 RdRp TACAAACCACGCCAGGTAGT 56
CoV2ID477 PCR primer PCR PCR primer forward SARS-CoV-2_IBS_S2_F GCTGGTGCTGCAGCTTATTA 22340 - 22359 S GCTGGTGCTGCAGCTTATTA 56
CoV2ID478 PCR primer PCR PCR primer reverse SARS-CoV-2_IBS_S2_R AGGGTCAAGTGCACAGTCTA 22428 - 22447 S TAGACTGTGCACTTGACCCT 56
CoV2ID479 PCR primer PCR PCR primer forward SARS-CoV-2_IBS_E2_F TTCGGAAGAGACAGGTACGTTA 26259 - 26280 E TTCGGAAGAGACAGGTACGTTA 56
CoV2ID480 PCR primer PCR PCR primer reverse SARS-CoV-2_IBS_E2_R AGCAGTACGCACACAATCG 26356 - 26374 E CGATTGTGTGCGTACTGCT 56
CoV2ID481 PCR primer PCR PCR primer forward SARS-CoV-2_IBS_N2_F GCTGCAATCGTGCTACAACT 28736 - 28755 N GCTGCAATCGTGCTACAACT 56
CoV2ID482 PCR primer PCR PCR primer reverse SARS-CoV-2_IBS_N2_R TGAACTGTTGCGACTACGTG 28836 - 28855 N CACGTAGTCGCAACAGTTCA 56
CoV2ID483 PCR primer Nested PCR PCR primer forward Yip_RdRp_outer_F AGGTATTGGGAACCTGAGTTTTATGAGGCTATGTACACAC 16180 - 16219 RdRp AGGTATTGGGAACCTGAGTTTTATGAGGCTATGTACACAC 57
CoV2ID484 PCR primer Nested PCR PCR primer reverse Yip_RdRp_outer_R ACCTGGAGCATTGCAAACATACGGATTAACAGACAAGAC 16360 - 16398 RdRp GTCTTGTCTGTTAATCCGTATGTTTGCAATGCTCCAGGT 57
CoV2ID485 PCR primer Nested PCR PCR primer forward Yip_RdRp_Inner_F CGCATACAGTCTTRCAGGCT 16220 - 16239 RdRp CGCATACAGTCTTACAGGCT 57
CoV2ID486 PCR primer Nested PCR PCR primer reverse Yip_RdRp_Inner_R GTGTGATGTTGAWATGACATGGTC 16330 - 16352 RdRp GACCATGTCATATCAACATCACA 57
CoV2ID487 PCR primer Nested PCR PCR probe Yip_RdRp_probe TTAAGATGTGGTGCTTGCATACGTAGAC 16276 - 16303 RdRp TTAAGATGTGGTGCTTGCATACGTAGAC 57
CoV2ID488 PCR primer Nested PCR PCR primer forward Yip_RdRp_outer_F AATTGCACAATTTGCCCCCAGCGCTTCA 29182 - 29209 N AATTGCACAATTTGCCCCCAGCGCTTCA 57
CoV2ID489 PCR primer Nested PCR PCR primer reverse Yip_RdRp_outer_R TGCGTCAATATGCTTATTCAGCAAAATGACTTGATCTTTGA 29310 - 29350 N TCAAAGATCAAGTCATTTTGCTGAATAAGCATATTGACGCA 57
CoV2ID490 PCR primer Nested PCR PCR primer forward Yip_RdRp_Inner_F GCGTTCTTCGGAATGTCG 29210 - 29227 N GCGTTCTTCGGAATGTCG 57
CoV2ID491 PCR primer Nested PCR PCR primer reverse Yip_RdRp_Inner_R TTGGATCTTTGTCATCCAATTTG 29284 - 29306 N CAAATTGGATGACAAAGATCCAA 57
CoV2ID492 PCR primer Nested PCR PCR probe Yip_RdRp_probe AACGTGGTTGACCTACACAGST 29257 - 29278 N AACGTGGTTGACCTACACAGGT 57